Falleció el [[25 de julio]] de [[1492]] a los 59 o 60 años. Según el cronista [[Stefano Infessura]] (fuente de autores posteriores), murió tras un intento fallido de [[transfusión de sangre]] que su médico judío, Giacomo di San Genesio, llevó a cabo vertiendo en la boca del pontífice la sangre de tres niños de diez años de edad, que murieron en la operación.<ref group="lower-alpha">[[Stefano Infessura]]: ''[https://archive.org/stream/diariodellacitt01infeuoft#page/275/mode/1up Diaria rerum romanarum]'', pp. 275-276; lo repitió [[César Baronio]]: [https://archive.org/stream/annalesecclesias30barouoft#page/186/mode/1up Annales ecclesiastici], vol. XXX, p. 186. Sin embargo, el embajador Francesco Valori, que relató la enfermedad y muerte del papa ([http://www.europeana.eu/portal/record/9200143/299F3E6DB185C0153112D2DD621A2298FC017A90.html Johannis Burchardi Diarium], pp. 567 y ss.) no menciona nada de este asunto.</ref>Para otros autores, como el periodista, escritor y apologista católicoescritor [[Vittorio Messori]], esto no sucedió y el relato de la transfusión no seríaes más que una leyenda negra contra la Iglesia.<ref>Vittorio Messori: ''[http://www.traditio-op.org/apologetica/Leyendas_negras_de_la_Iglesia.pdf Leyendas negras de la iglesia]'', pp. 158-159.</ref>