PorUna tenervez con su nombre limpio y ser una heroína tras haber salvado millones de vidas y haber descubierto quién estaba detrás de los ataques terroristas, Alex noes puedereclutada serpor unala agente[[CIA]] secretatras haber sido despedida del FBI,puesy sucomienza caraa estátrabajar enencubierta todasal parteslado de Ryan Booth. Mediante el uso de flashforwards, se revela que el Presidente y la Primera Dama de Estados Unidos son mantenidos como rehénes al lado de otros líderes mundiales por un grupo terrorista que amenaza con asesinarlos si no cumplen con sus demandas.
Así tiempo después mientras su relación con Ryan parece encaminarse, es reclutada por la CIA, o eso parece, porque en Quantico nada es simple, comienza a trabajar encubierta al lado de ¡Oh Sorpresa! Ryan Booth.
Nuevamente la serie transcurre en 2 tiempos mediante el uso de flashforwards, hace un año entraba en la Granja como aspirante a miembro operativo de la CIA mientras hoy una crisis con miles de rehenes estalla y solo ALex puede hacer algo. El Presidente y la Primera Dama de Estados Unidos son mantenidos como rehenes por un grupo terrorista que amenaza con asesinarlos si no cumplen con sus demandas.
Alex intentará salvar a la mayor cantidad de personas dentro y fuera de los edificios tomados ya que los terroristas cuentan con un arma biológica.
Pero nuevamente hay complot dentro del complot y descubrir quien es amigo y quien no será muy difícil.
