Los mejillones requieren de una fuente constante de agua fresca, limpia, con profundidades no fangosos. Prefieren el agua con un contenido mineral sustancial, porque necesitan el carbonato de calcio para construir sus cáscaras. Sobreviven temporalmente fuera del agua.
Hay mejillones de agua dulce, como ''Dreissena polymorpha'' (mejillón cebra) y ''Dreissena bugensis'', con carácter de especies invasoras, que llegan a obturar conductos de irrigación y abastecimiento de aguas dulces, donde no tenían depredador conocido, pero en los grandes lagos de Norteamérica, algunos peces, como ''Coregonus clupeaformis'' y ''Neogobius melanostomus'' se estarían adaptando a alimentarse de esos mejillones.<ref>Nature 543, 488–489 (23 Marzo del 2017) [http://www.nature.com/nature/journal/v543/n7646/pdf/543488a.pdf]</ref>
