Cuando murió Martín Lutero en [[1546]], comenzaron los problemas financieros para Catalina, ahora sin el sueldo de Lutero como profesor y pastor. Le ofrecieron la posibilidad de mudarse de la vieja abadía, pero la propuesta fue rechazada inicialmente. Al poco tiempo, Catalina tuvo que huir a [[Magdeburgo]] debido a la [[guerra de [[Esmalcalda]]. El acercamiento de la guerra forzó otra huida en [[1547]], esta vez a [[Brunswick]]. En julio de ese año, se acaba la guerra y vuelve a Wittenberg. Los edificios y las tierras del monasterio habían sido destruidos y estaban llenos de basura. Económicamente, no podían permanecer allí. Gracias a la generosidad de Juan Federico I de Sajonia y a los príncipes de [[Anhalt]], permanece en Wittenberg hasta [[1552]], cuando un brote de [[peste negra]] la forzó a salir de la ciudad una vez más. Huyó a [[Torgau]] donde su carro estuvo implicado en un accidente cerca de las puertas de la ciudad, que le causó una rotura de [[pelvis]] entre otras heridas. Catalina murió en Torgau tres meses después, el [[20 de diciembre]] de [[1552]], a los 53 años de edad. Fue enterrada en la iglesia de [[Torgau]], lejos del sepulcro de su marido en Wittenberg.
