La Creación de la ENES Morelia se aprobó el 099 de diciembre de 2011, en sesión extraordinaria del H. Consejo Universitario. El 066 de agosto de 2012 inició las actividades formales con tres licenciaturas de las doce que actualmente se imparten clases en la institución.<ref>{{Cita web|url=http://www.enesmorelia.unam.mx/index.php/institucional/enes-morelia/|título=ENES Morelia {{!}} ENES Unidad Morelia|fechaacceso=3 de marzo de 2018|sitioweb=www.enesmorelia.unam.mx|idioma=es-ES}}</ref> En ese entonces, fungiendo como director, el Dr. Alberto Ken Oyama Nakagawa.<ref>{{Cita web|url=https://www.sabermas.umich.mx/archivo/entrevista/115-numero-1528/230-dr-alberto-ken-oyama-nakagawa.html|título=DR. ALBERTO KEN OYAMA NAKAGAWA|fechaacceso=3 de marzo de 2018|apellido=Mendoza|nombre=Roberto Carlos Martínez Trujillo y Fernando Covián|sitioweb=Revista de divulgación Saber más UMSNH|idioma=es-es}}</ref>