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A partir del siglo XVII se constituye la ciencia tal como es considerada en la actualidad, con un objeto y método independizado de la filosofía.
 
En un punto fue necesaria la confrontación de dos sistemas ([[Descartes]]-[[Isaac Newton|Newton]]) contemporáneos en la concepción del mundo natural:<ref>Historia de la Ciencia (4 tomos), tomo I, p.11 y ss.</ref>
 
* [[Descartes]], ''Principia philosophiae'' ([[1644]]), a pesar de su indudable modernidad, mantiene la herencia de la filosofía anterior anclada en las formas divinas y propone un método basado en la deducción a partir de unos principios, las ideas innatas, formas esenciales y divinas como «principios del pensar».<ref>{{Cita enciclopedia |enciclopedia=Enciclopedia Oxford de Filosofía |apellido-editor=Honderich |nombre-editor=T. |año=2001 |editorial=Tecnos |ubicación=Madrid |isbn=84-309-3699-8 |página=256 |cita=Descartes estaba inequívocamente convencido de que si pudiera llegar al extremo de establecer la existencia de Dios, "en quien se esconde toda la sabiduría de la ciencia", podría luego proceder al establecimiento de una ciencia física sistemática que cubriera "la totalidad de esa naturaleza corpórea que es el tema de estudio de la matemática pura". (Meditación Quinta)}}</ref> El [[mundo]] es un «[[mecanicismo|mecanismo]]» [[determinismo|determinista]] regido por unas leyes determinadas que se pueden conocer como ciencia mediante un riguroso método de [[cálculo|análisis]] a partir de intuiciones [[Evidencia (filosofía)|evidentes]]. Es la consagración definitiva de la nueva ciencia, el triunfo del antiaristotelismo medieval, la imagen heliocéntrica del mundo, la superación de la división del universo en mundo sublunar y supralunar en un único universo mecánico.
* [[Isaac Newton|Newton]], ''Principia Mathematica philosophiae naturalis'', ([[1687]]). Manteniendo el espíritu anterior sin embargo realiza un paso más allá: el rechazo profundo a la hipótesis cartesiana de los vórtices. La ciencia mecanicista queda reducida a un cálculo matemático a partir de la mera [[experiencia]] de los hechos observados sobre un espacio-tiempo inmutable.
 
Tanto uno como otro daban por supuesto la exactitud de las leyes naturales deterministas fundadas en la voluntad de Dios creador. Pero mientras el determinismo de Descartes se justifica en el riguroso método de ideas a partir de hipótesis sobre las regularidades observadas, Newton constituía el fundamento de dichas regularidades y su necesidad en la propia «observación de los hechos». Mientras uno mantenía un concepto de ciencia «deductiva», el otro se presentaba como un verdadero «inductivista», [[Hypotheses non fingo]].
 
=== Método hipotético-deductivo ===
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