Far Cry 4 se desarrolla en una región ficticia del [[Himalaya]] llamada Kyrat, un país probablemente basado en [[Bután]]. El personaje principal del juego es Ajay Ghale, un muchacho de origen Kyratí, criado en los Estados Unidos, que viajó a Kyrat para cumplir el último deseo de su madre, Ishwari Ghale, quien quiere que sus cenizas sean "devueltas" junto a Lakshmana. Llegando a Kyrat, el joven Ajay es interceptado por miembros del ejército real kyratí y Pagan Min en persona, el rey tirano de Kyrat quien ha instauradoregión enusurpado lael regióntrono unay especieconvertido dela monarquia en dictadura-monarquía tras matar al rey anterior y a su familia. y que ha logrado elevar su figura a tal punto que algunas personas de la población llegan a considerarlo como un Dios. Ajay es secuestrado por el ejército real y conducido a la mansión de Paul "De Pleur" Harmon (uno de los tres gobernadores de Kyrat). Después de una incómoda comida con Pagan Min y dos personas más, Darpan (acompañante al inicio y miembro de la Senda Dorada) y De Pleur, Ajay huye del complejo guiado por Sabal otro miembro de la Senda Dorada que te topas a la salida, siendo Darpan capturado y torturado. Ajay se las resuelve para sobrevivir en medio del ambiente salvaje de Kyrat. Después de aquel día la vida de Ajay se ve envuelto en medio de un caos constante y guerrillas contra el ejército, acompañado de sus fieles compañeros de la Senda Dorada, una causa rebelde fundada por su padre, Mojan Ghale, que planea derrocar el régimen del vil Pagan y de todos sus aliados. En ella se encuentran dos futuros líderes de la Senda, el antes mencionado Sabal y Amita, quienes tienen una grave rivalidad debido a sus distintos puntos de vista. De ambos, solo uno será el líder supremo del futuro Kyrat una vez derrocado Pagan Min haciendo uso constante del dicho "el fin justifica los medios". Así pues, el juego permite tomar decisiones personales que influirán en el final de la historia, pudiendo escoger realizar misiones para Amita o bien para Sabal. Las decisiones del personaje provocarán que uno de ellos tome el control de la Senda Dorada, y por lo tanto de Kyrat al finalizar el juego, sustituyendo a la monarquíadictadura de Pagan Min y a su régimen.
Si se escoge a Sabal, este colocará un gobierno orientado en la vida religiosa y en el culto a las deidades de dicha religión, utilizando incluso matar a los que no están de acuerdo con su gobierno y los antiguos seguidores de Amita. El problema es que el país no tendrá dinero para modernizarse ya que sus fuentes de ingreso son mínimas y suponen un atraso enorme en la región, impidiéndole a sus habitantes tener educación digna o servicios de salud, por ejemplo.
