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Es Profesor de Investigación del [[CSIC]], Laboratory Consultant del ''Los Alamos National Laboratory'' y Profesor Externo del ''Santa Fe Institute'', ambos en Nuevo México, Estados Unidos. También es ''Senior Research Fellow and Principal Investigator'' de la Universidad de Harvard donde investiga la interfaz entre Física y Biología.<ref name="Cab"/>
 
Fue fundador del [[Centro de Astrobiología]] (CAB) y su primer director. El CAB está asociado al ''Nasa Astrobiology Institute''.<ref name="Harvard">{{Cita web |url=http://eps.harvard.edu/people/juan-perez-mercader |título=Juan Pérez Mercader |fechaacceso=17 de febrero de 2015 |apellido= |nombre= |enlaceautor= |fecha= |formato= |obra= |editor=Harvard.edu |editorial= |ubicación= |idioma=inglés |cita= }}</ref>
 
Es el arquitecto de la participación española con infraestructura e instrumentación a bordo del ''Mars Science Laboratory'' que llegó a Marte en agosto de 2012.<ref name="Harvard"/>
1924

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