Diferencia entre revisiones de «Ontología génica»
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Si se decide que un término de la ontología no es apropiado, es desaprobado, o marcado como "obsoleto". Esto puede pasar por diferentes razones, como estar fuera del objetivo de la ontología o estar engañosamente nombrado o definido.
El archivo de la ontología está gratuitamente disponible en el [http://www.geneontology.org/ sitio web del GO]; se puede buscar y navegar entre los términos usando el ''navegador GO'' [https://web.archive.org/web/20080418195200/http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi?search_constraint=terms&action=replace_tree AmiGO]. El proyecto de Ontología del Gen también provee mapeos de sus términos a otros sistemas de clasificación que cubren la misma área de la biología.
== Asociaciones de la ontología génica ==
Un número de organizaciones, incluyendo las bases de datos de organismos modelo y de proteínas multiespecie, desarrollan análisis de secuencias de proteínas y genera tablas de ''asociaciones'' entre los supuestos productos génicos y los términos GO. Estas están gratuitamente disponibles en el sitio web del GO, y pueden ser [https://web.archive.org/web/20100322202832/http://www.geneontology.org/GO.current.annotations.shtml bajadas] individualmente o vistas en línea usando [https://web.archive.org/web/20080418195200/http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi?search_constraint=terms&action=replace_tree AmiGO].
En muchas bases de datos de secuencias genéticas antiguas, las anotaciones cuentan con pocas, o ninguna, indicaciones sobre su procedencia, por lo que el usuario no puede fácilmente comprobar la naturaleza y fuerza de la evidencia que las respalda, lo cual lleva a lo que es conocido en este campo como ''problema de anotación transitiva''. Algunos genes son caracterizados por experimentos reales (''[[wet lab]]''), y su secuencia depositada en una base de datos principal y pública con anotaciones de esos experimentos. Otras secuencias que no han sido caracterizadas en el laboratorio son anotadas de acuerdo a su similaridad con aquélla secuencia, y estas otras secuencias, a cambio, forman la base para posteriores anotaciones, y así sucesivamente. De esta forma, el usuario no puede saber cuántos pasos de similitud entre secuencias hay entre las anotaciones de algunas secuencias genéticas y cualquier dato de experimento real.
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