Un estudio realizado por el [[ Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano |Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano]] en [[Bethesda (Maryland)|Bethesda, Maryland]], investigó el ADN de hongos de la piel humana en 14 lugares diferentes del cuerpo. Estos fueron el canal auditivo, entre las cejas, la parte posterior de la cabeza, detrás de la oreja, el talón, las uñas de los pies, entre los dedos de los pies, el antebrazo, la espalda, la ingle, las fosas nasales, el pecho, la palma y la curva del codo. El estudio mostró una gran diversidad de hongos en todo el cuerpo, siendo el hábitat más rico el talón, que alberga alrededor de 80 especies de hongos. Por el contrario, hay unas 60 especies en recortes de uñas y 40 entre los dedos. Otras áreas ricas son la palma, el antebrazo y el interior del codo, con 18 a 32 especies. La cabeza y el tronco albergan entre 2 y 10 cada uno.<ref>[https://www.bbc.co.uk/news/health-22622689 BBC News item]</ref><br>
Una de las principales especies de la piel no humana es ''[[Batrachochytrium dendrobatidis]]'', un hongo zoospórico [[Chytridiomycota|quítrido]] y no hifal que causa la [[quitridiomicosis]], una enfermedad infecciosa que se considera responsable de la [[Declive en las poblaciones de anfibios|disminución de las poblaciones de anfibios]].<ref>{{Cita publicación|título=Pathogenesis of Chytridiomycosis, a Cause of Catastrophic Amphibian Declines|apellidos=Voyles|nombre=Jamie|apellidos2=Young|nombre2=Sam|fecha=2009-10-23 de octubre de 2009|publicación=Science|volumen=326|número=5952|páginas=582–585|idioma=en|bibcode=2009Sci...326..582V|issn=0036-8075|doi=10.1126/science.1176765|pmid=19900897|apellidos3=Berger|nombre3=Lee|apellidos4=Campbell|nombre4=Craig|apellidos5=Voyles|nombre5=Wyatt F.|apellidos6=Dinudom|nombre6=Anuwat|apellidos7=Cook|nombre7=David|apellidos8=Webb|nombre8=Rebecca|apellidos9=Alford|nombre9=Ross A.}}</ref>
==== Microbioma umbilical ====
El [[ombligo]] es un área del cuerpo que rara vez está expuesta a la luz ultravioleta, jabones o secreciones corporales<ref name="esa2011">{{Cita web|url=https://www.sciencedaily.com/releases/2011/08/110803174757.htm|título=Bellybutton microbiomes: Ecological research on the human biome|fechaacceso=2013-04-20 de abril de 2013|autor=Ecological Society of America|fecha=4 de agosto de 2011-08-04|sitioweb=ScienceDaily|formato=Press Release}}</ref> (el ombligo no produce secreciones ni aceites)<ref>{{Cita noticia|apellidos=Nierenberg|nombre=Cari|título=New meaning to 'navel-gazing': Scientists study belly button bacteria|url=https://www.nbcnews.com/health/new-meaning-navel-gazing-scientists-study-belly-button-bacteria-1C6437445?franchiseSlug=healthmain|fechaacceso=2013-09-29 de septiembre de 2013|fecha=2011-04-14 de abril de 2011}}</ref> y porque es una comunidad casi intacta de bacterias<ref name="Hulcr">{{Cita publicación|título=A Jungle in There: Bacteria in Belly Buttons are Highly Diverse, but Predictable|apellidos=Hulcr|nombre=Jirir|apellidos2=Andrew M. Latimer|fecha=7 Novemberde noviembre de 2012|publicación=PLoS ONE|volumen=7|número=11|páginas=e47712|bibcode=2012PLoSO...747712H|doi=10.1371/journal.pone.0047712|pmc=3492386|pmid=23144827|apellidos3=Jessica B. Henley|apellidos4=Nina R. Rountree|apellidos5=Noah Fierer|apellidos6=Andrea Lucky|apellidos7=Margaret D. Lowman|apellidos8=Robert R. Dunn}}</ref> es una excelente parte del microbioma de la piel para estudiar.<ref>{{Cita web|url=http://www.yourwildlife.org/projects/belly-button-biodiversity/|título=The Wild Life of Your Body|fechaacceso=1 Septemberde septiembre de 2013}}</ref> El ombligo es un microbioma húmedo del cuerpo<ref name="Kong">{{Cita publicación|título=Skin microbiome: genomics-based insights into the diversity and role of skin microbes|apellidos=Kong|nombre=Hiedi|fecha=June 17, de junio de 2011|publicación=Trends Mol. Med.|volumen=17|número=6|páginas=320–8|doi=10.1016/j.molmed.2011.01.013|pmc=3115422|pmid=21376666}}</ref> (con alta humedad y temperaturas),<ref name="ncbi.nlm.nih.gov">{{Cita publicación|título=The Skin Microbiome|apellidos=Grice|nombre=Elizabeth|apellidos2=Julia Segre|fecha=9 Aprilde abril de 2011|publicación=Nat Rev Microbiol|volumen=9|número=4|páginas=244–53|doi=10.1038/nrmicro2537|pmc=3535073|pmid=21407241}}</ref> que contiene una gran cantidad de bacterias,<ref>{{Cita noticia|apellidos=Kaplan|nombre=Karen|título=Study shows you're covered in bacteria - live with it.|url=http://www.highbeam.com/doc/1G1-200941418.html?key=01-42160D517E1A14691A0E031B07664B36254D35463B78700E730E0B60641A617F1371193F|archive-url=https://web.archive.org/web/20131111044351/http://www.highbeam.com/doc/1G1-200941418.html?key=01-42160D517E1A14691A0E031B07664B36254D35463B78700E730E0B60641A617F1371193F|fechaarchivo=11 Novemberde noviembre de 2013|fechaacceso=29 Septemberde septiembre de 2013|periódico=The Star|fecha=1 Junede junio de 2009}}</ref> especialmente bacterias que favorecen condiciones húmedas como Corynebacterium<ref>{{Cita publicación|título=Topographical and Temporal Diversity of the Human Skin Microbiome|apellidos=Grice|nombre=Elizabeth|apellidos2=Heidi H. Kong|fecha=29 May 2009|publicación=Science|volumen=324|número=5931|páginas=1190–2|bibcode=2009Sci...324.1190G|doi=10.1126/science.1171700|pmc=2805064|pmid=19478181|apellidos3=Sean Conlan|apellidos4=Clayton B. Deming|apellidos5=Joie Davis|apellidos6=Alice C. Young|apellidos7=Gerard G. Bouffard|apellidos8=Robert W. Blakesley|apellidos9=Patrick R. Murray}}</ref> y Estafilococo.
El Proyecto de Biodiversidad Belly Button comenzó en la Universidad Estatal de Carolina del Norte a principios de 2011 con dos grupos iniciales de 35 y 25 voluntarios.<ref name="Hulcr">{{Cita publicación|título=A Jungle in There: Bacteria in Belly Buttons are Highly Diverse, but Predictable|apellidos=Hulcr|nombre=Jirir|apellidos2=Andrew M. Latimer|fecha=7 Novemberde noviembre de 2012|publicación=PLoS ONE|volumen=7|número=11|páginas=e47712|bibcode=2012PLoSO...747712H|doi=10.1371/journal.pone.0047712|pmc=3492386|pmid=23144827|apellidos3=Jessica B. Henley|apellidos4=Nina R. Rountree|apellidos5=Noah Fierer|apellidos6=Andrea Lucky|apellidos7=Margaret D. Lowman|apellidos8=Robert R. Dunn}}</ref> Los voluntarios recibieron hisopos de algodón estériles y se les pidió que insertaran los hisopos de algodón en sus ombligos, que giraran el hisopo de algodón tres veces y luego devolvieran el hisopo de algodón a los investigadores en un vial<ref name="Parker-Pope">{{Cita web|url=http://well.blogs.nytimes.com/2011/04/14/whats-in-your-belly-button/?_r=1|título=What's in Your Belly Button|fechaacceso=2013-09-29 de septiembre de 2013|autor=Parker-Pope|nombre=Tara|fecha=2011-04-14 de abril de 2011}}</ref> que contenía 0,5 ml de solución buffer salina de fosfato al 10%. Investigadores de la Universidad Estatal de Carolina del Norte, liderados por Jiri Hulcr,<ref name="Nierenberg">{{Cita web|url=https://www.nbcnews.com/health/new-meaning-navel-gazing-scientists-study-belly-button-bacteria-1C6437445?franchiseSlug=healthmain|título=New meaning to 'navel-gazing': Scientists study Belly Button Bacteria|fechaacceso=2013-09-29 de septiembre de 2013|autor=Nierenberg|nombre=Cari}}</ref> luego cultivaron las muestras hasta que las colonias bacterianas fueron lo suficientemente grandes como para ser fotografiadas y luego estas imágenes fueron publicadas en el sitio web del Proyecto de Biodiversidad de Belly Button (se dieron muestras a los voluntarios números para que puedan ver sus propias muestras en línea). Estas muestras se analizaron luego utilizando bibliotecas de ADNr 16S para poder identificar las cepas que no crecían bien en los cultivos.
Los investigadores de la Universidad Estatal de Carolina del Norte descubrieron que, si bien era difícil predecir cada cepa de bacterias en el microbioma del ombligo, podían predecir qué cepas serían frecuentes y qué cepas de bacterias serían bastante raras en el microbioma.<ref name="Hulcr">{{Cita publicación|título=A Jungle in There: Bacteria in Belly Buttons are Highly Diverse, but Predictable|apellidos=Hulcr|nombre=Jirir|apellidos2=Andrew M. Latimer|fecha=7 Novemberde noviembre de 2012|publicación=PLoS ONE|volumen=7|número=11|páginas=e47712|bibcode=2012PLoSO...747712H|doi=10.1371/journal.pone.0047712|pmc=3492386|pmid=23144827|apellidos3=Jessica B. Henley|apellidos4=Nina R. Rountree|apellidos5=Noah Fierer|apellidos6=Andrea Lucky|apellidos7=Margaret D. Lowman|apellidos8=Robert R. Dunn}}</ref> Se descubrió que los microbiomas del ombligo solo contenían unos pocos tipos prevalentes de bacterias (Staphylococcus, Corynebacterium, Actinobacteria, Clostridiales y Bacilli) y muchos tipos diferentes de bacterias raras. Se descubrieron otros tipos de organismos raros dentro de los ombligos de los voluntarios, incluidos tres tipos de Archaea (un organismo que generalmente vive en ambientes extremos) y dos de los tres tipos de Archaea se encontraron en un voluntario que afirmó no haberse bañado o duchado durante muchos años.
''Staphylococcus'' y ''Corynebacterium'' se encuentran entre los tipos más comunes de bacterias que se encuentran en los ombligos de los voluntarios de este proyecto y estos tipos de bacterias son los tipos más comunes de bacterias que se encuentran en la piel humana en estudios más amplios del microbioma de la piel<ref name="Callewaert">{{Cita publicación|título=Characterization of Staphylococcus and Corynebacterium Clusters in the Human Axillary Region|apellidos=Callewaert|nombre=Chris|apellidos2=Frederiek-Maarten Kerckhof|fecha=12 Augustde agosto de 2013|publicación=PLOS ONE|volumen=8|número=8|páginas=e70538|bibcode=2013PLoSO...870538C|doi=10.1371/journal.pone.0070538|pmc=3741381|pmid=23950955|apellidos3=Michael S. Granitsiotis|apellidos4=Mireille Van Gele|apellidos5=Tom Van de Wiele|apellidos6=Nico Boon}}</ref> (del cual forma parte el Proyecto de Biodiversidad de Belly Button).<ref name="Hulcr">{{Cita publicación|título=A Jungle in There: Bacteria in Belly Buttons are Highly Diverse, but Predictable|apellidos=Hulcr|nombre=Jirir|apellidos2=Andrew M. Latimer|fecha=7 Novemberde noviembre de 2012|publicación=PLoS ONE|volumen=7|número=11|páginas=e47712|bibcode=2012PLoSO...747712H|doi=10.1371/journal.pone.0047712|pmc=3492386|pmid=23144827|apellidos3=Jessica B. Henley|apellidos4=Nina R. Rountree|apellidos5=Noah Fierer|apellidos6=Andrea Lucky|apellidos7=Margaret D. Lowman|apellidos8=Robert R. Dunn}}</ref> (En estos estudios más amplios se ha encontrado que las mujeres generalmente tienen más ''Staphylococcus'' viviendo en sus microbiomas de la piel (generalmente ''Staphylococcus epidermidis'')<ref name="Parker-Pope">{{Cita web|url=http://well.blogs.nytimes.com/2011/04/14/whats-in-your-belly-button/?_r=1|título=What's in Your Belly Button|fechaacceso=2013-09-29 de septiembre de 2013|autor=Parker-Pope|nombre=Tara|fecha=2011-04-14 de abril de 2011}}</ref> y que los hombres tienen más ''Corynebacterium'' viviendo en sus microbiomas de la piel.)
Según el Proyecto de Biodiversidad del ombligo<ref name="Hulcr">{{Cita publicación|título=A Jungle in There: Bacteria in Belly Buttons are Highly Diverse, but Predictable|apellidos=Hulcr|nombre=Jirir|apellidos2=Andrew M. Latimer|fecha=7 Novemberde noviembre de 2012|publicación=PLoS ONE|volumen=7|número=11|páginas=e47712|bibcode=2012PLoSO...747712H|doi=10.1371/journal.pone.0047712|pmc=3492386|pmid=23144827|apellidos3=Jessica B. Henley|apellidos4=Nina R. Rountree|apellidos5=Noah Fierer|apellidos6=Andrea Lucky|apellidos7=Margaret D. Lowman|apellidos8=Robert R. Dunn}}</ref> en la Universidad Estatal de Carolina del Norte, se encuentran dos tipos de microorganismos en el ombligo y las áreas circundantes. Las bacterias transitorias (bacterias que no se reproducen)<ref name="Kong">{{Cita publicación|título=Skin microbiome: genomics-based insights into the diversity and role of skin microbes|apellidos=Kong|nombre=Hiedi|fecha=June 17, de junio de 2011|publicación=Trends Mol. Med.|volumen=17|número=6|páginas=320–8|doi=10.1016/j.molmed.2011.01.013|pmc=3115422|pmid=21376666}}</ref> forman la mayoría de los organismos que se encuentran en el ombligo, y se estima que se encontraron 1400 cepas diferentes en el 95% de los participantes del estudio.<ref name="saunders-blog">{{Cita web|url=http://www.alumniblog.ncsu.edu/2011/07/12/navel-gazing-at-nc-state-leads-to-important-discovery/|título=Navel gazing at NC State leads to important discovery|fechaacceso=2013-04-20 de abril de 2013|autor=Saunders|nombre=Chris|fecha=2011-07-12 de julio de 2011|sitioweb=Red & White for Life :: NC State University Alumni Association}}</ref>
El Proyecto de Biodiversidad Belly Button está en curso y ahora ha tomado muestras de más de 500 personas.<ref name="Hulcr">{{Cita publicación|título=A Jungle in There: Bacteria in Belly Buttons are Highly Diverse, but Predictable|apellidos=Hulcr|nombre=Jirir|apellidos2=Andrew M. Latimer|fecha=7 Novemberde noviembre de 2012|publicación=PLoS ONE|volumen=7|número=11|páginas=e47712|bibcode=2012PLoSO...747712H|doi=10.1371/journal.pone.0047712|pmc=3492386|pmid=23144827|apellidos3=Jessica B. Henley|apellidos4=Nina R. Rountree|apellidos5=Noah Fierer|apellidos6=Andrea Lucky|apellidos7=Margaret D. Lowman|apellidos8=Robert R. Dunn}}</ref> El proyecto fue diseñado con el objetivo de contrarrestar esa idea errónea de que las bacterias siempre son dañinas para los humanos<ref>{{Cita web|url=http://newscientist.com/blogs/shortsharpscience/2011/04/belly-button-biome-is-more-tha.html|título=Belly button biome is more than a piece of fluff|fechaacceso=2013-09-29 de septiembre de 2013|autor=Aldhous|nombre=Peter}}</ref> y que los humanos están en guerra con las bacterias.<ref>{{Cita web|url=http://www.bbc.co.uk/programmes/b011jv8r|título=Human microbes|fechaacceso=2013-09-29 de septiembre de 2013}}</ref> En realidad, la mayoría de las cepas de bacterias son inofensivas<ref name="ncbi.nlm.nih.gov">{{Cita publicación|título=The Skin Microbiome|apellidos=Grice|nombre=Elizabeth|apellidos2=Julia Segre|fecha=9 Aprilde abril de 2011|publicación=Nat Rev Microbiol|volumen=9|número=4|páginas=244–53|doi=10.1038/nrmicro2537|pmc=3535073|pmid=21407241}}</ref> si no son beneficiosas para el cuerpo humano.<ref>{{Cita publicación|título=Skin Commensals Regulate Skin Immunity|apellidos=Ahmad|nombre=Salar|apellidos2=Shailly Anand|fecha=September 2012|publicación=Indian J. Microbiol.|volumen=52|número=3|páginas=517–8|doi=10.1007/s12088-012-0301-z|pmc=3460106|pmid=23997352|apellidos3=Rup Lal}}</ref> Otro de los objetivos del proyecto es fomentar el interés público en la microbiología.<ref name="Nierenberg">{{Cita web|url=https://www.nbcnews.com/health/new-meaning-navel-gazing-scientists-study-belly-button-bacteria-1C6437445?franchiseSlug=healthmain|título=New meaning to 'navel-gazing': Scientists study Belly Button Bacteria|fechaacceso=2013-09-29 de septiembre de 2013|autor=Nierenberg|nombre=Cari}}</ref> Trabajando en concierto con el Proyecto del Microbioma Humano, el Proyecto de Biodiversidad de la Ombligo también estudia las conexiones entre los microbiomas humanos y los factores de edad, sexo, origen étnico, ubicación y salud en general.<ref>{{Cita publicación|título=The Human Microbiome: Our Second Genome|apellidos=Grice|nombre=Elizabeth|apellidos2=Julia Segre|fecha=6 Junede junio de 2012|publicación=Annu Rev Genom Hum Genet|volumen=13|número=1|páginas=151–70|doi=10.1146/annurev-genom-090711-163814|pmc=3518434|pmid=22703178}}</ref>
== Relación con el anfitrión ==
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