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Además de sus muchos libros, Ernst Haeckel escribió:
* ''Generelle Morphologie der Organismen : allgemeine Grundzüge der organischen Formen-Wissenschaft, mechanisch begründet durch die von C. Darwin reformirte Decendenz-Theorie.'' 1866. Berlín
* ''Natürliche Schöpfungsgeschichte'' (1868) — ''La historia de la creación'', en inglés: ''[https://web.archive.org/web/20121022155413/http://www.geology.19thcenturyscience.org/books/1876-Haeckel-HistCrea/Vol-I/htm/doc.html The History of Creation: Or the Development of the Earth and its Inhabitants by the Action of Natural Causes]'' (1876; 6.ª ed.: New York, D. Appleton & Co., 1914, 2 vols.) Ilustración de la portada y la portada [//de.wikiversity.org/wiki/Haeckel,_Ernst_(1868)]
* ''Freie Wissenschaft und freie Lehre'' (1877, ''Libertad en ciencias y libertad en la enseñanza''), réplica al escrito donde [[Virchow]] objectó la enseñanza de la [[evolución]] en escuelas, en la idea de que la evolución era una hipótesis no probada.<ref name="Ha1911">
"Biography of Ernst Heinrich Haeckel, 1834–1919" (article),
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