También, se define como el número total de microorganismos que componen la microbiota y su material genético, lo que no hay que confundir con [[Microbiota normal|microbiota]] que es la población microbiana existente en el organismo.<ref name=arreglo>{{cita web |url= http://ecoosfera.com/2014/12/el-fascinante-microbioma-humano-que-es-y-porque-es-importante-que-lo-sepas/#/0|título= El fascinante microbioma humano (qué es y por qué es importante que lo sepas)|fechaacceso=13 de febrero de 2017 |apellido= Sierra|nombre= A.|fecha= 2 de diciembre de 2014|sitioweb= Ecoosfera|idioma= |cita= }}</ref>
ÉsteEste término se acuñó tras el estudio de bacterias ácidas de la mano de [[Iliá Méchnikov|Elie Metchnikoff]] que recibió un Premio Nobel por sus estudios en inmunidad. Es sabido que existe un impacto en la salud del organismo debido a variaciones en la microbiota [[Simbiosis|simbionte]] que alberga el organismo aunque la composición genética de esta microbiota, es decir: el microbioma, no varíe a pesar de que el número de bacterias cambie, pero se ha comprobado que el desajuste del microbioma provoca numerosas patologías que afectan al organismo como la [[Enfermedad de Crohn]] en el ser humano.<ref>{{cita publicación|apellidos1=Williams Turpin et al.|título=Association of host genome with intestinal microbial composition in a large healthy cohort|publicación=Nature Genetics|fecha=2016|volumen=48|número=11|página=1413-1417|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27694960}}</ref> Otros factores genéticos que influyen en la variación del genoma son los genes: CYP27A1 y NR5A2 implicados en el metabolismo de [[ácidos biliares]]; HNF4A y PLA2G3, en la [[homeostasis]] de ácidos biliares; HTR1E y GRID1 como componentes potenciales del eje cerebro-intestino; y CLEC16A (SNP: rs12931878) que es un gen asociado a varios trastornos autoinmunes e inflamatorios que provocan alteraciones en la microbiota intestinal.<ref name=":0">{{Cita publicación|url=|título=Genome-wide association analysis identifies variation in vitamin D receptor and other host factors influencing the gut microbiota|apellidos=Jun Wang|nombre=|fecha=2016|publicación=Nature Genetics, Vol.48, 11:1396-1403|fechaacceso=|doi=|pmid=}}</ref> Existen variantes genéticas que se [[Correlación|correlacionan]] con la estructura del microbioma intestinal y que podría estar muy asociada a la composición de la [[microbiota intestinal]] tanto como los taxones individuales o asociados. Podría ser que [[Receptor de vitamina D|VDR]] y [[Proopiomelanocortina|POMC]] sean los mayores reguladores del microbioma intestinal humano.<ref name=":0" />
En 2017 se funda el primer banco internacional de super- donantes de microbiota [http://www.microbioma.org www.microbioma.org] activo en España, Estados Unidos, Canadá, Australia, Nueva Zelanda, Reino Unido y Francia a fecha de junio de 2019 con el fin de optimizar los parámetros de compatibilidad entre donante y receptor mediante algoritmos de inteligencia artificial.
