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[[Archivo:HLA-A11.png|thumb|274px|right|Interpretación de [[HLA-A11]] mostrando las subunidades: <span style="color:#00CBC8">α (producto de gen A*1101 )</font> y <span style="color:#F08080">β (Beta-2 microglobin)</font>. Este receptor tiene un <span style="color:#EEC700">péptido unido </font> (en su [[bolsillo de unión]]) de origen heterólogo que contribuye a su función.]]
En la [[biología estructural]], la '''subunidad de una proteína''' es una única [[molécula]] [[Proteína|proteica]] que se une permanentemente o de manera temporal, con otras moléculas proteicas para formar un [[complejo proteico]]: una proteína ''multimerica'' o ''oligomerica''. Muchas de las proteínas que se dan en la naturaleza y [[enzimas]] son multimericas. Algunos ejemplos incluyen: ''oligomericas'': [[hemoglobina]]s, [[ADN polimerasa]], [[nucleosoma]]s y ''multimericas'': [[canales iónicos]]s, [[microtúbulos]]s y algunas proteínas del [[citoesqueleto]]. Las subunidades de una proteína multimerica pueden parecer idénticas, [[homología (biología)|homólogos]] o totalmente diferentes y están dedicadas a tareas completamente diversas. En algunos plegamientos o uniones de estas proteínas, una subunidad se puede referir como la "subunidad reguladora" y la otra como la"subunidad catalitica."Una enzima que esté compuesta tanto de la unidad reguladora como la unidad catalítica cuando se une o se pliega se le refiere de manera recurrente como
Una subunidad está compuesta de una cadena de [[polipéptidos]].Una cadena de polipéptidos tiene un [[gen]] que codifica para este– esto quiere decir que una proteína debe tener un gen específico´ para cada subunidad.
Una subunidad es normalmente referida por una letra Griega o Romana, y los números de este tipo de subunidad en una proteína es indicado por un subscrito. Por ejemplo, [[ATP sintasa]] tiene un tipo de subunidad llamada &alfa. Tres de estas subunidades están presentes en la molécula de ATP sintasa, y por ende es designada como &alfa;<sub>3</sub>. Grupos más largos de subunidad también pueden ser especificados como, &alfa ;<sub>3</sub>β<sub>3</sub>-hexamero y anillo-c.
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