En 1854 Newton fue elegido "travelling fellow" del Magdalene College de [[Cambridge]], donde había estudiado, y visitó muchas parte del mundo, incluyendo [[Laponia]], [[Islandia]], [[Svalbard]], las [[Indias Occidentales]] y [[Norteamérica]]. En 1866 se convirtió en el primer profesor de zoología de la [[Universidad de Cambridge]] y anatomía comparada en Cambridge, un puesto en el que permaneció hasta su muerte. Sus servicios a la [[ornitología]] y a la [[zoología]] fueron reconocidos por la [[Royal Society]] en 1900 cuando le otorgó la medella real.
En 1858 Newton fue uno de los fundadores de la [[British Ornithologists' Union]]. Escribió numerosos libros, incluyendo ''Zoology of Ancient Europe'' (1862), ''Ootheca Wolleyana'' (comenzado en 1864), ''Zoology'' (1872), y un ''Dictionary of Birds'' (1893 - 1896). Newton contribuyó con numerosos artículos a sociedades científicas, y editó ''The Ibis'' (1865 - 1870), el ''Zoological Record'' (1870 - 1872), y ''Yarrell's British Birds'' (1871 - 1882).
Newton dedicó cierto tiempo al estudio de las aves de las [[Islas mascareñas]] cuya población descendía por momentos. En las islas se encontraba el hermano de Newton, Sir Edward Newton, que le enviaba especímenes. Estos incluían el [[Dodo]], el [[Solitario de Rodrigues]] (''[[Pezophaps solitaria]]''), ambos extintos. En 1872 fue la primera persona en describir el ''[[Psittacula exsul]]'' que también vivía en la isla de [[Isla de Rodrigues]]. Esta ave se extinguió en 1875.
