Diferencia entre revisiones de «Montaje de secuencias»
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Enfrentados al desafío de ensamblar el mucho más largo genoma de la mosca de la fruta [[Drosophila melanogaster]] en el año 2000, así como el genoma humano sólo un año después, los científicos desarrollaron montadores como el Celera Assembler (el primero desarrollado por una compañía privada) y Arachne, capaces de manejar genomas de 100-300 millones de pares de bases. Con posterioridad a estos esfuerzos, otros grupos, principalmente de los mayores centros de secuenciación, construyeron ensambladores a gran escala, y un esfuerzo de [[código abierto]] conocido como AMOS se lanzó para aglutinar todas las innovaciones en la tecnología de ensamblado de genomas bajo el marco de código abierto.
En ensamblado de [[Marcador de secuencia expresada|ESTs]] difiere del ensamblado de genomas en varias características. Por ejemplo, los genomas tienen, a menudo, grandes cantidades de secuencias repetitivas, principalmente en las partes intergénicas. Puesto que las ESTs representan transcripciones génicas, no contienen estas repeticiones. Por otra parte, los genes se solapan a veces en el genoma ([[transcripción sentido-antisentido]]), y podrían ser todavía ensamblados idealmente de forma separada. El montaje de ESTs también es complicado por características tales como (cis-)[[splicing alternativo]], [[trans-splicing]], [[Polimorfismo de nucleótido simple|polimorfismos de nucleótido simple]], [[recodificación]], y [[Modificación post-transcripcional|modificaciones post-transcripcionales]]. Estas diferencias hacen a las nuevas generaciones de ensambladores menos aplicables al ensamblaje de ESTs.
==[[Algoritmo voraz]] para el montado de secuencias==
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