A partir del [[siglo XVI]] los papas designaban además los protonotario honorarios, quienes disfrutaban de los mismos privilegios de los siete miembros reales del colegio; y de los protonotarios titulares, quienes mantenían un cargo correspondiente en la administración del ordinariato episcopal o en el capítulo del colegiado. Con el [[motu proprio]] (''Inter multíplices'') del [[21 de febrero]] de [[1905]] el papa [[Pío X]], definió el cargo de protonotarios: privilegios, vestimenta, e insignia a los miembros de cuatro clases:
*Los ''protonotarii apostolici de numero participantium'', (''protonotarios numerarios''): fueron los miembros ‘dentro de los numerarios’ del colegio de prelados, quienes ejercieron su cargo en conexión con los actos de consistorios y canonizaciones, conservando un representante en la Congregación de Propaganda, y de acuerdo con la reorganización de la curia por la constitución “''Sapienti concilio''” del [[29 de junio]] de [[1908]], firmaban las bulas papales en vez de los [[Abreviadores]]. Estos disfrutaban del uso de pontificales y numerosos privilegios, y además, después de examinar los candidatos, nombraban un número fijo de doctores de teología y derecho canónico.
*Los ''protonotarii apostolici supranumerarii'' (''protonotario apostólico supernumerario''),: que fue definida como una dignidad que sólo era concedida a los canónigos patriarcales de las cuatro basílicas mayores de Roma ([[Basílica de San Pedro]] del Vaticano, [[Basílica de San Pablo Extramuros]], [[Basílica de Santa María la Mayor]] y la [[Archibasílica de San Juan de Letrán]]) y a miembros de otros capítulos de catedrales fuera de Roma, a quienes se les había entregado este privilegio.
* Los ''protonotarii apostolici ad instar (participantium)'',: quienes eran elegidos por el papa y poseían la misma insignia externa de los protonotarios reales.
*Los ''protonotarii titulares seu honorarii'',: quienes se encontraban afuera de Roma y que recibían esta dignidad de los [[Nuncio Apostólico]]s o como un privilegio especial.
