Los SQUIDs se usan para medir [[campo magnético|campos magnéticos]] extremadamente pequeños; actualmente son los [[magnetómetro]]s más sensibles conocidos, con niveles de ruido de un mínimo de 3 fT/sqrt(Hz). Algunos procesos en [[animal]]es producen campos magnéticos muy débiles (típicamente de una billonésima a una milmillonésima de [[Tesla_(unidad)|Tesla]]), y los SQUIDs son muy adecuados para estudiar estos procesos.
La [[magnetoencefalografía]] (MEG), por ejemplo, usa medidas de una batería de SQUIDs para inferir la actividad neuronal en el cerebro. Como los SQUIDs pueden trabajar a mucha mayor velocidad que la tasa de actividad cerebral más rápida de interés, se puede obtener buena resolución temporal por MEG. Otra aplicación es el [[microscopio de barrido con SQUID]], que usa un SQUID inmerso en [[helio]] líquido como sonda. El uso de SQUIDs en [[prospección|prospecciones]] [[petróleo|petrolíferas]], predicción de [[terremoto]]s y análisis de [[energía geotérmica]] se va extendiendo conforme se desarrolla la tecnología de superconductores.
===Ciencia ficción===
El escritor de [[ciencia ficción]] [[William Gibson]] hizo referencia a los SQUIDs en su historia [[Johnny Mnemonic]], en la que un delfín modificado genéticamente usa un implante de SQUID para leer un dispositivo magnético de memoria en el cerebro del protagonista.
En la película '''Días extraños''' los protagonistas emplean SQUIDs para grabar las señales cerebrales, que luego, almacenadas en discos, se venden en el mercado negro para que la gente pueda revivir las experiencias de quien las grabó.
