La ortografía también es útil a la hora de distinguir palabras homófonas (palabras con la misma pronunciación pero con significado diferente),; aunque en la mayoría de los casos, la razón de esta diferenciación es histórica y no fue implementado con el propósito de hacer una distinción. Por ejemplo, las palabras "heir" y "air" se pronuncian idénticamente en muchos dialectos (como /ˈɛər/). Sin embargo, se distinguendistingue el uno del otro ortográficamente por medio de la adición de la letra 〈h〉. Otro ejemplo es el par de homófonos "plain" y "plane", los cuales se pronuncian /ˈpleɪn/ ambos, pero tienen dos formas diferentes para la vocal /eɪ/. (Normalmente esto es debido a la pronunciación histórica de cada palabra que, con el tiempo, dos sonidos separados devienendevinieron el mismo pero las diferencias ortográficas se mantienenmantuvieron: "plane" solía pronunciarse /ˈpleːn/, pero el sonido /eː/ se fusionó con el sonido /eɪ/ en "plain", convirtiendo "plain" y "plane" en homófonos.
En la lengua escrita, esto puede ayudar a resolver ambigüedades potenciales que podrían surgir (por ejemplo, compárese ''He's breaking the car'' con ''He's braking the car''). No obstante, todavía existen muchos homófonos que no se encuentran resueltos ortográficamente (por ejemplo, la palabra "bay" tiene por loal menos cinco significados fundamentalmente diferentes).
