El apellido de su familia, de remoto origen francés, era '''Bertrand'''. Su ciudad de origen ha dado lugar a controversias: en su testamento ―dictado al ingresar a la orden franciscana a los 16 años de edad― aseguró ser «natural de la ciudad de San Juan»,<ref>{{cita libro |apellido=Rivas |nombre=Alberto F. |título=Fray Luis Beltrán |editorial=Di Bello |año=1936 |página=34}}</ref><ref>{{cita libro |apellido=Claveras Salinas |nombre=José |título=Presbíteros, abates y frailes sanmartinianos |editorial=Buenos Aires: Sade |año=1989 |página=31}}</ref> pero como vivió su infancia en Mendoza, tradicionalmente se lo supuso originario de esa ciudad.
Estudió en [[Buenos Aires]] y [[Córdoba (Argentina)|Córdoba]], y se ordenó sacerdote en 1805 en [[Santiago de Chile]].
