osLos rizobios viven en el suelo donde se encuentran las raíces de las [[Fabaceae]]. La simbiosis comienza con un intercambio de señales entre los rizobios y la planta que permite el reconocimiento mutuo y el desarrollo de las estructuras simbioticas específicas. Las raíces de las plantas [[leguminosas]] secretan compuestos [[flavonoides]] que son sensados por los rizobios, disparando la producción de [[factores NOD]] por parte de las bacterias. A su vez los [[factores NOD]] son detectados por las raíces de las plantas e inducen la deformación de los [[pelos radiculares]] y otras respuestas fisiológicas. Este diálogo molecular es específico entre cada especie de leguminosa y rizobio de tal forma que cada planta produce un grupo específico de compuestos flavonoides que son detectados solamente por una o más especies de rizobios específicas de esa leguminosa.
Este mecanismo de reconocimiento entre la bacteria y la planta induce la [[división celular]] en el [[cortex]] la raíz formando un nuevo órgano: el [[nódulo]] que será posteriormente invadidos por las bacterias.<ref>{{cita publicación|apellidos1=Gage|nombre1=DJ|título=Infection and invasion of roots by symbiotic, nitrogen-fixing rhizobia during nodulation of temperate legumes.|publicación=Microbiology and molecular biology reviews : MMBR|fecha=de junio de 2004|volumen=68|número=2|páginas=280-300|doi=10.1128/MMBR.68.2.280-300.2004|pmid=15187185}}</ref>
