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'''LTR''' o '''repetición terminal larga''' (Abr. LTR, del inglés ''Long Terminal Repeat'') es una secuencia de [[nucleótidos]] característica que se encuentra en cada extremo de un elemento [[retrovirus|retroviral]] que ha sido integrado en el [[genoma]] hospedador. Está implicada en el proceso de integración.
 
== Transcripción ==
Las secuenicas LTR se transcriben parcialmente en un ARN intermediario, para posteriormente y mediante [[Transcripción inversa|transcripción reversa]] pasar al [[ADN complementario]] (ADNc) y finalmente al [[ADN bicatenario]] (dsADN de las siglas "double stranded") con LTRs completas. Las LTRs median la integración del DNA retroviral vía una [[integrasa]] específica de LTR presente en otra región del cromosoma hospedador. Las primeras secuencias LTR fueron descubiertas por A.P.Czernilofsky y J.Shine en 1977 y 1980.
 
Los [[Retroviridae|retrovirus]], como el [[Virus de la inmunodeficiencia humana|Virus de la Inmunodeficiencia Humana]] (VIH) emplean este tipo de mecanismos.
 
== Datación de inserciones retrovirales mediante el uso de LTRs ==
Dado que las LTR 5' y 3' son idénticas tras la inserción, la diferencia entre los LTRs apareados puede ser utilizada para estimar la edad de inserciones retrovirales anteriores. Este método de datación es empleado por [[paleovirólogos]], a pesar de que no tiene en cuenta factores "confusos" tales como la conversión génica y la recombinación homóloga.
 
== VIH-1 ==
La LTR del [[VIH-1]] mide aproximadamente 640 pb (pares de bases) y, al igual que otros LTRs retrovirales, está segmentada en las regiones U3, R y U5. U3 y U5 han sido posteriormente subdivididas de acuerdo a los sitios de unión a factores de transcripción y su impacto en la actividad LTR o la expresión viral. El proceso constituido por varias etapas de la transcripción reversa permite el emplazamiento de dos LTRs idénticas, cada una consistente en una región U3, una R y una U5, en cada uno de los extremos del DNA [[Provirus|proviral]].
 
Los extremos de las LTR participan subsecuentemente en la integración del provirus en el [[genoma]] hospedador. Una vez se ha integrado, la LTR de 5' funciona como promotor del genoma retroviral completo, mientras que la LTR de 3' proporciona la [[poliadenilación]] del ARN naciente y, en VIH-1, VIH-2 y SIV, codifica para la proteína accesoria [[Nef]].
 
Todas las señales requeridas para la expresión génica se encuentran en los LTRs: Enhancer, promotor (puede ser que tenga ambos enhancers transcripcionales o elementos reguladores), iniciación de la transcripción (como el capping), terminador de la transcripción y señal de poliadenilación.
 
En VIH-1 la región 5'UTR ha sido caracterizada de acuerdo a las diferencias funcionales y estructurales en diversas sub-regiones:
 
Gracias a esta secuencia, los retrovirus son utilizados en [[terapia génica]], usando estas secuencias como flanqueantes de los genes a introducir en un organismo.
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