La Universidad de York cuenta con una larga historia de huelgas de profesores y profesores adjuntos. En 1997 hubo una huelga de profesores (convocada por la YUFA, York University Faculty Association) que duró siete semanas. En ese momento fue la segunda huelga más larga en la historia de las universidades canadienses.<ref>[http://www.yufa.org/news/TenthAnniversaryStrike.html http://www.yufa.org/news/TenthAnniversaryStrike.html] (en inglés)</ref> Algunos de los motivos de la huelga fueron los relacionados con la jubilación, la financiación y el gobierno institucional. En el año 2001 los profesores y los profesores adjuntos estuvieron de huelga durante once semanas, lo que batió el récord de la propia universidad.<ref>[http://www.thestar.com/article/532380 http://www.thestar.com/article/532380] (en inglés)</ref> El motivo principal de esta huelga fue que la administración de la universidad propuso cancelar un acuerdo con respecto a la financiación —que consistía en aumentar los sueldos de los empleados de la universidad en la misma proporción al aumento de la matrícula.
El 6 de noviembre delde 2008 comenzó otra huelga<ref>[http://www.3903strike.ca/ http://www.3903strike.ca/] (en inglés)</ref> basada en muchas quejas institucionales que incluían seguridad profesional para profesores con contrato, eliminación del código de conducta, creación de un órgano encargado de proteger las prácticas ilegales dentro de la profesión y una indexación de los fondos. El 20 de enero de 2009 el CUPE 3909 (Canadian Union of Public Employees, Asociación canadiense de funcionarios) venció una ratificación de voto impuesta a la universidad, que hubiese acabado con la huelga. El 24 de enero el primer ministro de Ontario, [[Dalton McGuinty]] convocó una inusual sesión dominical en el Parlamento para aprobar una ley de vuelta al trabajo que significase el fin inmediato de la huelga.<ref>[http://web.archive.org/web/20090201211842/http://www.cbc.ca/canada/toronto/story/2009/01/24/york-strike.html "Ontario to legislate end to York University strike", CBC News, January 24, 2009 (en inglés)]</ref> El 29 de enero se aprobó la York University Labour Disputes Resolution Act (''Resolución de disputas laborales de la Universidad de York'') dando por terminada la huelga de 85 días que ha sentado precedentes para futuras huelgas universitarias en Ontario.<ref>[http://web.archive.org/web/http://sfs.yorku.ca/fees/tco/ http://sfs.yorku.ca/fees/tco/] (en inglés)</ref> Se ofrecieron ayudas a los estudiantes que tras la huelga sufrieron apuros económicos por la extensión del año académico.
