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La siguiente tabla grafica el origen de los principales grupos de algas cromistas de acuerdo a diversos investigadores:
[[Archivo:Lingulodinium polyedrum.jpg|thumb|165px|derecha|''[[Lingulodinium]]'', un alga [[Dinophyceae]].]]
 
{| class="wikitable"
 
[[Archivo:Chilomonas - 400x (8999832507).jpg|thumb|180px|''[[Chilomonas]]'', una criptofita incolora.]]
 
=== Pérdida de los plastos ===
Hay varias casos en los que se ha perdido los plastos y en consecuencia la capacidad fotosintética. Es el caso por ejemplo de los [[pseudohongo]]s, los cuales tienen paredes con celulosa como las algas, pues si bien no se han encontrado restos vestigiales de plastos, sí se han identificado genes provenientes de [[rodoplasto]]s del tipo alga roja endosimbionte.<ref>Thomas Richards & Nicholas Talbot 2007, [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2633911/ Plant Parasitic Oomycetes Such as Phytophthora Species Contain Genes Derived from Three Eukaryotic Lineages] Plant Signal Behav. 2(2): 112–114.</ref> Los [[Apicomplexa|apicomplejos]] son [[esporozoo]]s parásitos que presentan [[apicoplasto]]s, los cuales son orgánulos derivados de plastos relacionados con los que poseen las algas [[Chromerida]].<ref>Geoffrey I. McFadden 2014, [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982214000256 Apicoplast.] Current Biology, Volume 24, Issue 7, 31 March 2014, Pages R262–R263</ref> Otro ejemplo es ''[[Chilomonas]]'', la cual es una [[Cryptophyceae|criptofícea]] que ha perdido su fototrofía, pero ha conservado un [[leucoplasto]] con su [[nucleomorfo]].<ref>M.D. Guiry in Guiry, M.D. & Guiry, G.M. 2017. [http://www.algaebase.org/search/genus/detail/?genus_id=43569 Chilomonas Ehrenberg, 1831] AlgaeBase. World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. http://www.algaebase.org; searched on 05 February 2017.</ref>