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Dentro de las herramientas taxonómicas diseñadas para facilitar la determinación de los organismos se encuentran las claves, éstas pueden ser dicotómicas, politómicas o con sangría. Las dicotómicas tienen dos opciones, cada una contiene una serie de caracteres contrastantes entre sí, está diseñada de tal forma en que sólo una opción puede aceptarse, a cada par de alternativas a escoger se le llama copla o dilema.<ref> Jones, S. B. 1988. Sistemática vegetal. McGraw-Hill, México, D.F.</ref>
 
El objetivo de la clasificación es ordenar o disponer por clases a los organismos. En la década de los ochenta se utilizaba una serie de palabras para presentar un arreglo particular de acuerdo con algún principio de relación que se creía existía en los organismos.<ref name="Wiley_1"> Wiley, E.O. 1981. Phylogenetics: The theory and practice of philogenetic systematics. John Wiley & Sons, New York </ref> Pero ya para 1990 comenzó a emplearse un sistema de palabras y símbolos que denotaban conceptos.<ref name="Llorente_1"> Llorente, J. 1990. La búsqueda del método natural. Fondo de Cultura Económica, La ciencia desdes México, 95, México, D.F.</ref>
 
En términos de clasificación biológica existen jerarquías, se refieren a los rangos que denotan grupos ordenados en una secuencia de conjuntos y subconjuntos, incluidos sucesivamente.<ref name="Llorente_1"> Llorente, J. 1990. La búsqueda del método natural. Fondo de Cultura Económica, La ciencia desdes México, 95, México, D.F.</ref>
 
La clasificación artificial, agrupa a los organismos por atributos designados de acuerdo a sus similitudes o sobre la base de su utilidad, en el caso de seres vivos se hace sin que exista ninguna hipótesis de relación o teoría biológica como ancestralidad común.<ref name="Llorente_2"> Llorente, J. 1990. La búsqueda del método natural. Fondo de Cultura Económica, La ciencia desde México, 95, México, D.F.</ref>
 
A diferencia de la clasificación artificial, la clasificación natural se basa en las relaciones genealógicas y que sólo contienen grupos monofiléticos, los cuales están conformados por grupos de especies que incluyen un ancestro y sus descendientes.
.<ref name="Wiley_1"> Wiley, E.O. 1981. Phylogenetics: The theory and practice of philogenetic systematics. John Wiley & Sons, New York </ref> Desde la época de Linneo los taxónomos han intentado desarrollar clasificaciones naturales, sin embargo hasta antes de la publicación de El origen de las especies de Darwin, las clasificaciones no reflejaban la historia evolutiva de los grupos.<ref> Moreno, N. 1984. Glosario botánico ilustrado. Compañía Editorial Continental- Instituto Nacional de Investigaciones sobre Recursos Bióticos, México, D.F. </ref>
 
De los conceptos aceptados en el siglo XXI se asume que la clasificación natural debe reflejar relaciones filogenéticas entre las especies a clasificar.<ref name="Llorente_2"> Llorente, J. 1990. La búsqueda del método natural. Fondo de Cultura Económica, La ciencia desde México, 95, México, D.F.</ref>
 
La clasificación filogenética está basada en relaciones genealógicas entre grupos de organismos.<ref name="Wiley_1"> Wiley, E.O. 1981. Phylogenetics: The theory and practice of philogenetic systematics. John Wiley & Sons, New York </ref>
 
== Escuelas sistemáticas ==