PROSITE
PROSITE es una base de datos de familias y dominios de proteínas creada por Amos Bairoch en 1988.[1][2] Consiste en entradas que describen dominios, familias y sitios funcionales así como patrones de aminoácidos. Estos son manualmente verificados por un equipo del Instituto Suizo de Bioinformática e integrado con la base de datos de Swiss-Prot.
| PROSITE | ||
|---|---|---|
| Información general | ||
| Dominio | http://prosite.expasy.org/ | |
| Tipo |
Base de datos biológica Base de datos en línea | |
| Idiomas disponibles | Inglés | |
| En español | No | |
| Gestión | ||
| Desarrollador | Amos Bairoch | |
Sus usos incluyen la identificación de posibles funciones de las proteínas recientemente descubiertas y el análisis de aquellas ya conocidas pero con actividades previamente desconocidas. PROSITE ofrece herramientas para el análisis de secuencias de proteínas y detección de motivos de proteínas; es parte de los servidores de análisis de proteómica de ExPASy.
La base de datos ProRule se basa en las descripciones de dominio de PROSITE.[3] Esta proporciona información adicional acerca de funcionalidades o de aminoácidos estructuralmente críticos. Las reglas contienen información sobre los residuos biológicamente significativos, como sitios activos, sitios de unión a sustrato o cofactores, modificaciones postraduccionales o enlaces disulfuro, para ayudar a determinar la función. Estas pueden automáticamente generar anotaciones basados en los motivos de PROSITE.
Referencias editar
- ↑ De Castro E, Sigrist CJA, Gattiker A, Bulliard V, Langendijk-Genevaux PS, Gasteiger E, Bairoch A, Hulo N (2006). «ScanProsite: detection of PROSITE signature matches and ProRule-associated functional and structural residues in proteins». Nucleic Acids Res. 34 (Web Server issue): W362-365. PMID 16845026. doi:10.1093/nar/gkl124.
- ↑ Hulo N, Bairoch A, Bulliard V, Cerutti L, Cuche B, De Castro E, Lachaize C, Langendijk-Genevaux PS, Sigrist CJA (2007). «The 20 years of PROSITE». Nucleic Acids Res. 36: D245. PMID 18003654. doi:10.1093/nar/gkm977.
- ↑ Sigrist CJ, De Castro E, Langendijk-Genevaux PS, Le Saux V, Bairoch A, Hulo N (2005). «ProRule: a new database containing functional and structural information on PROSITE profiles». Bioinformatics. 21(21): 4060-4066. PMID 16091411. doi:10.1093/bioinformatics/bti614.
Enlaces externos editar
Datos: Q899676
