Abrir menú principal

DPANN es un supergrupo de arqueas de pequeño tamaño que constituyen un clado y al que se asigna usualmente la categoría de superfilo. Fue propuesto en 2013 por Rinke y colaboradores[1]​ para englobar a un grupo de arqueas relacionadas con las nanoarqueas (las únicas cultivadas). DPANN es un acrónimo formado por las iniciales de los cinco primeros grupos descubiertos, Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota y Nanohaloarchaeota. El superfilo DPANN agrupa filos con una variedad de distribución ambiental y metabolismo, que van desde formas simbióticas y termófilas obligatorias como Nanoarchaeota, acidófilos como Parvarchaeota y no extremófilos como Aenigmarchaeota y Diapherotrites.

Symbol question.svg
 
DPANN
25K15pA9Def4sec Arman 4 Box1.png
Célula ARMAN encontrada en una mina de hierro
Taxonomía
Dominio: Archaea
Superfilo: DPANN
Rinke et al. 2013
Filos

CaracterísticasEditar

Se caracterizan por su pequeño tamaño, en consonancia con su pequeño genoma, por lo que tienen capacidades catabólicas limitadas pero suficientes como para llevar una vida libre. En su mayoría no pueden cultivarse, son extremófilas, anaerobias y pueden ser termófilas, hiperacidófilas, hiperhalófilas o metaloresistentes, encontrándose también en entornos acuáticos comunes.

ClasificaciónEditar

  • Diapherotrites. Encontradas mediante el análisis filogenético de los genomas recuperados de la filtración de aguas subterráneas de una mina de oro abandonada en EE.UU.[2][3]
  • Parvarchaeota y Micrarchaeota. Descubiertas en 2006 en aguas residuales fuertemente ácidas de una mina de EE.UU..[4][5][6]​ Son de muy pequeño tamaño y provisionalmente se las denominó ARMAN (Archaeal Richmond Mine Acidophilic Nanoorganisms).
  • Woesearchaeota y Pacearchaeota. Se han identificado tanto en sedimentos como en aguas superficiales de acuíferos y lagos, abundando especialmente en condiciones salinas.[7][8]
  • Aenigmarchaeota. Encontradas en las aguas residuales de minas y en sedimentos de fuentes termales.[9]
  • Nanohaloarchaeota. Distribuidas en ambientes de alta salinidad.[10]
  • Nanoarchaeota. Fueron las primeras descubiertas (en 2002) en una fumarola oceánica próxima a la costa de Islandia. Viven como simbiontes de otras arqueas.[11][12][13]

ReferenciasEditar

  1. Rinke, C., Schwientek, P., Sczyrba, A., Ivanova, N. N., Anderson, I. J., Cheng, J. F., ... & Dodsworth, J. A. (2013). Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. Nature, 499(7459), 431-437.
  2. Genomes Online Database
  3. Comolli LR, Baker BJ, Downing KH, Siegerist CE, Banfield JF (2009) Three-dimensional analysis of the structure and ecology of a novel, ultra-small archaeon. ISME J 3:159–167.
  4. Baker, B. J., Tyson, G. W., Webb, R. I., et al.(2006) “Lineages of acidophilic archaea revealed by community genomic analysis,” Science, 314(5807):1933–1935.
  5. Murakami, S., Fujishima, K., Tomita, M., Kanai, A.(2012) Metatranscriptomic analysis of microbes in an ocean-front deep subsurface hot spring reveals novel small RNAs and type-specific tRNA degradation. Applied and Environmental Microbiology 78(4):1015-22.
  6. B. J. Baker, L. R. Comolli, G. J. Dick, L. J. Hauser, D. Hyatt, B. D. Dill, M. L. Land, N. C. VerBerkmoes, R. L. Hettich, J. F. Banfield. Enigmatic, ultrasmall, uncultivated Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences (2010).
  7. Castelle, C. J., Wrighton, K. C., Thomas, B. C., Hug, L. A., Brown, C. T., Wilkins, M. J., ... & Taylor, R. C. (2015). Genomic expansion of domain archaea highlights roles for organisms from new phyla in anaerobic carbon cycling. Current Biology, 25(6), 690-701.
  8. Ortiz‐Alvarez, R., & Casamayor, E. O. (2016). High occurrence of Pacearchaeota and Woesearchaeota (Archaea superphylum DPANN) in the surface waters of oligotrophic high‐altitude lakes. Environmental microbiology reports.
  9. Takai, K., Moser, D. P., DeFlaun, M., Onstott, T. C. & Fredrickson, J. K. Archaeal diversity in waters fromdeep south african gold mines. Appl. Environ. Microbiol. 67, 5750–5760 (2001).
  10. Narasingarao, P. et al. (2012). "De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities". ISME J. 6 (1): 81–93.
  11. Waters, E., Hohn, M. J., Ahel, I., Graham, D. E., Adams, M. D., Barnstead, M., Beeson, K. Y., Bibbs, L., Bolanos, R., Keller, M., Kretz, K., Lin, X., Mathur, E., Ni, J., Podar, M., Richardson, T., Sutton, G. G., Simon, M., Soll, D., Stetter, K. O., Short, J. M., Noordewier, M. (2003).
  12. “The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism”. Proc Natl Acad Sci U S A 100 (22): 12984–8.
  13. Podar, M., Makarova, K. S., Graham, D. E., Wolf, Y. I., Koonin, E. V., Reysenbach, A. L. (2013). Insights into archaeal evolution and symbiosis from the genomes of a nanoarchaeon and its inferred crenarchaeal host from Obsidian Pool, Yellowstone National Park. Biol. Direct 8:9