Péptido señal

El péptido señal, constituido por unos 20 aminoácidos en orden particular, que son los primeros que aparecen cuando se está sintetizando la cadena polipeptídica.
Representación esquemática de un péptido señal.

Un péptido señal está constituido por unos 5 a 30 aminoácidos que están colocados en un orden particular y que son los primeros que aparecen cuando se está sintetizando la cadena polipeptídica. El péptido señal decide sobre el destino, la ruta de transporte y la eficiencia de secreción de una proteína.[1][2]

CaracterísticasEditar

Un péptido señal (dependiendo de proteína Sec, eucariota) tiene tres regiones distintas. Primero el n-región que tiene aminoácidos con carga positiva (Lys, Arg, His) o negativa (Asp, Glu),después la h-región que es hidrofóbica y por último la c-región con el sitio de reconocimiento por la peptidasa señal (SPase).

Clases de péptidos señalEditar

Designación Composición Compartimento de destino Organismo
Señal de localización nuclear - clásica (NLS) -PKKKRKV-[3] Núcleo celular Eukaryota
Péptido señal dependiendo de proteína Sec Por ejemplo:

H2N-MDWTWRVFCLLAVTPGAHP-[1]

Retículo endoplasmático o fuera de la célula Eukaryota
Mitochondrial targeting signal 10-70 aminoácidos por ejemplo:

H2N-MLSLRQSIRFKPATRTLCSSRYLL-

Matriz mitocondrial Eukaryota
Peroxisomal targeting signal (PTS1) -S(A/C)-K(R/H)-L(M)-COOH[4] Peroxisoma Eukaryota
Peroxisomal targeting signal (PTS2) 9 aminoácidos (discontinuo)[4] Peroxisoma Eukaryota
twin-arginine signal peptide -(S/T)-R-R-x-F-L-K-[5] Envoltura celular bacteriana o fuera de la célula Procariota
Péptido señal dependiendo de proteína Sec H2N-MIKLKFGVFFTVLLSSAYA-[1] Envoltura celular bacteriana o fuera de la célula Procariota / Bacteria Gram negativa

Leyenda:

H2N- = N-término de la proteína

-COOH = C-término de la proteína

ReferenciasEditar

  1. a b c Kober L, Zehe C, Bode J (abril de 2013). «Optimized signal peptides for the development of high expressing CHO cell lines». Biotechnol. Bioeng. 110 (4): 1164-73. PMID 23124363. doi:10.1002/bit.24776. 
  2. von Heijne G (Jul de 1985). «Signal sequences: The limits of variation». J Mol Biol 184 (1): 99-105. PMID 4032478. doi:10.1016/0022-2836(85)90046-4. 
  3. Kalderon, D. et al. (1984): A short amino acid sequence able to specify nuclear location. In: Cell. 39 (3 Pt 2): 499–509. PMID 6096007 doi 10.1016/0092-8674(84)90457-4
  4. a b Brown LA und Baker A (2003): Peroxisome biogenesis and the role of protein import. In: J Cell Mol Med 7(4) S. 388-400 PMID 14754507
  5. Taylor, P.D. et al. (2006): TATPred: a Bayesian method for the identification of twin arginine translocation pathway signal sequences. In: Bioinformation. Bd. 1, Nr. 5, S. 184-187. PMID 17597885