Diferencia entre revisiones de «Aconitasa»

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Su estructura está dividida en 4 dominios globulares presentados con el siguiente orden: 4, 1, 2 y 3. Entre los dominios 3 y 4 hay un linker joining (estructura proteica) que varía dependiendo de la conformación funcional. En la aconitasa citosólica es más largo y estructurado (593 a 654) que en la mitocondrial (513 a 536). El sitio activo está formado por aminoácidos de los cuatro dominios.<ref name=":0" /><ref name=":3">{{Cita publicación|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0969212605003886|título=Crystal Structure of Human Iron Regulatory Protein 1 as Cytosolic Aconitase|apellidos=Dupuy|nombre=Jérôme|apellidos2=Volbeda|nombre2=Anne|fecha=1 de enero de 2006|publicación=Structure|editorial=Elsevier|volumen=14|número=1|páginas=129–139|fechaacceso=6 de octubre de 2018|idioma=inglés|issn=0969-2126|doi=10.1016/j.str.2005.09.009|pmid=|apellidos3=Carpentier|nombre3=Philippe|apellidos4=Darnault|nombre4=Claudine|apellidos5=Moulis|nombre5=Jean-Marc|apellidos6=Fontecilla-Camps|nombre6=Juan Carlos}}</ref> Los dominios del 1 al 3 están muy compactados, a diferencia del cuarto que es mucho más flexible. Existe un plegamiento que difiere en ambos tipos en el dominio 1 para la región N-terminal, residuos del 1 al 33. Las inserciones en diferentes dominios provoca que las estructuras tridimensionales de las dos isoenzimas (citosólica y metabólica) sean distintas.
 
Cuando la proteína cataliza la isomerización del citrato a D-isocitrato, si está inactiva, contiene un grupo [3Fe-4S] en el [[sitio activo]], mientras que, para que la aconitasa esté activa y realice esta función, se debe ligar un átomo más de hierro, creando un grupo [4Fe-4S]<sup>2+</sup>.<ref>{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2726740|título=Structure of activated aconitase: formation of the [4Fe-4S] cluster in the crystal|apellidos=Robbins|nombre=A. H.|apellidos2=Stout|nombre2=C. D.|fecha=1989-5|publicación=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volumen=86|número=10|páginas=3639–3643|fechaacceso=6 de octubre de 2018|idioma=en|issn=0027-8424|doi=|pmc=PMC287193287193|pmid=2726740}}</ref> En cambio, cuando la proteína desempeña funciones relacionadas con ácidos nucleicos, no presenta ninguno de los dos grupos mencionados. La pérdida del grupo formado por átomos de hierro y azufre provoca un cambio en la conformación, resultando en un sitio activo con una mayor abertura, permitiéndole así tener un sustrato diferente.<ref name=":1" /><ref name=":3" /><ref name=":4">{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17185597|título=Structure of dual function iron regulatory protein 1 complexed with ferritin IRE-RNA|apellidos=Walden|nombre=William E.|apellidos2=Selezneva|nombre2=Anna I.|fecha=22 de diciembre de 2006|publicación=Science|volumen=314|número=5807|páginas=1903–1908|fechaacceso=6 de octubre de 2018|ubicación=New York, N.Y.|idioma=inglés|issn=1095-9203|doi=10.1126/science.1133116|pmid=17185597|apellidos3=Dupuy|nombre3=Jérôme|apellidos4=Volbeda|nombre4=Anne|apellidos5=Fontecilla-Camps|nombre5=Juan C.|apellidos6=Theil|nombre6=Elizabeth C.|apellidos7=Volz|nombre7=Karl}}</ref>
 
== Clasificación y funciones de la aconitasa ==