En Cuenca no existía una institución de educación secundaria, hasta que en 1853, Juan Bautista Vázquez congresista por Azuay ante la Cámara de Representantes, impulsó la creación del colegio, hecho que se logró en 1858, cuando el Senado y la Cámara resolvieron establecer en la ciudad de Cuenca el colegio San Gregorio. El presidente [[Francisco Robles]] firmó el ejecútese en octubre del mismo año, creando así el primer colegio en la ciudad. En 1910, el colegio cambió de nombre a Colegio Nacional [[Benigno Malo]], en honor a un ilustre cuencano de principios del {{siglo|XIX||s}}.<ref>{{Cita web|url=https://www.eltelegrafo.com.ec/noticias/regional/1/150-anos-del-emblematico-colegio-benigno-malo|título=150 años del emblemático colegio Benigno Malo|fechaacceso=2022-01-24|apellido=Telégrafo|nombre=El|fecha=2014-06-08|sitioweb=El Telégrafo|idioma=es-es}}</ref>
