Cuando parecia que se viviria el descenso, inesperadamente durante el draft de [[Ixtapa]], se anunció la venta del León por Valente Aguirre a Francisco Bernat, quién anunció el [[21 de junio]]: ¡[[León]] se convierte en [[Puebla F.C.]]!, desmintiendo a [[Valente Aguirre]] que en la compra no hay ningún impedimento de llevarselo y afirmó: "Si lo compramos es para llevarlo a Puebla, somos Poblanos y tenemos una responsabilidad con nuestra afición de darles futbol de primera división nacional... Ahora que si hay gente que quiere que el equipo permanezca en [[León]], que nos pague los 9 millones de dólares que nos costó". Ello generó protestas de la afición cuerera que evitó la desaparión de su equipo. El [[23 de junio]] se anúncia que [[Puebla]] regresa a [[Primera División Mexicana]], León se queda y permanece en la ciudad, siendo adquirido por Roberto Zermeño, y que [[Unión de Curtidores]] desaparece. Los jugadores solo se intercambiaron por lo que Puebla se quedó con jugadores adquiridos por León y el León con los de Curtidores que se volvió Puebla F.C. La franquicia del Puebla que habia descendido se volvió [[Angeles de Puebla]], además llegó otra franquicia llamada [[Lobos BUAPUAP]] proveniente del [[Truenos de Cuautitlán]] en Primera "A". Cabe mencionar que antes de esta temporada la ciudad no contaba con futbol de ascenso.
Sin embargo fue otro decepcionante regreso, pues en Invierno 99' obtuvo 20 unidades y fue cesado a media temporada [[José Marí Bakero]], llegó [[Mario Carrillo]] que renunció al cargo tras el termino del torneo. El Verano [[2000]] se calificó al golear en la última jornada al [[Atlas]] 5-1, pero [[Toluca]] en cuartos masacró al Puebla con un contundente global de 9-0. Al mando del equipo estuvo [[Miguel Mejia Barón]].
