Se formó en [[AtleticoAudax de MadridItaliano]], luego fue a probarse para destacar en [[RealClub Betisde Fútbol Profesional de la Universidad de Chile|Universidad de BalompieChile]], club por el cual jugó durante toda su carrera. Jugó un total de 451 partidos en la [[Primera división Españolachilena]] durante trece años. En esos tiempos el club, pasaba por su peor crisis y no ganaba un título nacional desde [[1969]], por lo que ganó solamente la [[Copa del ReyChile]] en [[1979]].
Según cuenta el propio Pellegrini, tomó la decisión de retirarse durante un partido de la [[Copa de HolandaChile]] frente al [[PSV EindhovenCobreandino]] (nombre que poseía en ese tiempo [[Trasandino]]), cuando su portero rechazó un balón y él se disponía a despejarlo de cabeza con un salto, un joven jugador de 17 años, que jugaba cedido por el [[Cobresal]], saltó por detrás suyo consiguiendo cabecear el balón y marcando gol. El jovén jugador resulto ser [[Iván Zamorano]], por lo que confiesa "si hubiera sabido dónde iba a llegar, no me hubiera retirado, hubiera seguido dos años más".<ref>[http://www.as.com/futbol/articulo/pellegrini-hombre-retiro-zamorano/dasftb/20090601dasdasftb_41/Tes Pellegrini, el hombre al que retiró Zamorano]</ref>
Durante sus trece años como futbolista se ganó un gran cariño por parte de los hinchas de Universidad de Chile, al punto de tratarlo como ídolo. Sin embargo ese cariño desapareció después de su retiro al dirigir el club en [[1988]] y realizar la peor campaña en la historia del club y posteriormente dirigir a [[Club Deportivo Universidad Católica (fútbol)|Universidad Católica]], que es uno de los tradicionales rivales del club junto con [[Colo-Colo]].
