Dentro de las series de [[manga]] sobresale {{nihongo|''[[Naruto]]''|ナルト}}(que es uno de los mejorea animes/mangas del mundo y le sujiero que lo vean), creada por [[Masashi Kishimoto]], la cual fue más tarde llevada al [[anime]]. El manga trata sobre un ninja [[adolescencia|adolescente]] llamado [[Naruto Uzumaki]] y apareció publicado por primera vez por [[Shūeisha]] en [[1999]] en el número 43 de la revista ''[[Shōnen Jump]]'' en [[Japón]],<ref>{{cita web|url=http://jump.heavy.jp/ac.htm|título=Mangas publicados entre los años 1990 y 1999 en la revista Shōnen Jump|fechaacceso=18/1/2008|idioma=Japonés}}</ref> y en ella continúa su edición con un capítulo por semana, recopilados hasta ahora en [[Anexo:Volúmenes de Naruto|44 volúmenes]]. Entre otras series destacan ''[[Azumi]]'', ''[[Ninja Scroll]]'', ''[[Ninja Boy Rantaro]]'', ''[[Ninja Hatori]]'', ''[[Basilisk]]''. Una de las más exitosas series en la década de los sesenta fue "[[Kamui, El Ninja Desertor]]" escrita y dibujada por [[Sanpei Shirato]].
