El argumento del juego puede variar un poco respecto a la Mitología Griega original, pero se asemeja bastante.
Del caos y el desorden del Universo nacieron los primeros titanes, entre ellos [[Gea]] ('''Gaia''' o '''Gaya''') personificada como la '''Madre Tierra'''. Sin ayuda masculina dio a luz a [[Urano (mitología)|UrgsdgdanoUrano]], el titán del '''Cielo''' y a [[Pontos]], el titán del '''Mar'''. Gea tomó a Urano por esposo y juntos engendraron a otros titanes, el más joven de ellos fue el titán del '''Tiempo''', [[Cronos]].. Así los titanes reinaron el universo y Urano se convirtió en su líder. Gea y Urano engendraron otros vástagos, incluyendo a los [[cíclope]]s. Urano, asustado por alguno de sus engendros los ocultó en el lugar más remoto de la '''Tierra''', más allá del Inframundo, conocido como "[[Tártaro (mitología)|Tártaro]]". Gea sufrió mucho e insitó a su hijo Cronos para castrar a su padre. Así Urano (el cielo) se separó de Gea (la tierra) y Cronos liberó a los encerrados en el Tártaro y se hizo con el reino de los dioses. Cronos desposó a su hermana [[Rea]], y Gea desposó a Pontos. Cronos y Rea tuvieron seis hijos entre los que se cuentan [[Poseidón]], [[Hades]] y [[Zeus]]. Cronos temía que sus hijos formaran una revuelta como la que él protagonizó contra su padre, por lo que se tragó a sus hijos; sólo el menor de ellos, Zeus se salvó gracias a la protección de su madre Rea. Cuando Zeus creció obligó a su padre Cronos a regurgitar a sus hermanos y más tarde protagonizó una revuelta conocida como la [[Titanomaquia]]. Finalmente los dioses olímpicos ganaron y Zeus encerró a la mayoría de los titanes (no todos) en el Tártaro. El Tártaro ha permanecido cerrado desde entonces... hasta ahora.
El juego contiene una nueva campaña llamada '''"La Nueva Atlántida"''' y se remonta a diez años después de la destrucción de la Atlántida ''(véase [[Age of Mythology]])''. Trata acerca de [[Anexo:Personajes de Age of Mythology#Castor|Castor]], el hijo del divinizado [[Anexo:Personajes de Age of Mythology#Arkantos|Arkantos]] y cómo la civilización atlante revive el culto a estas antiguas deidades, además de cómo los [[Titán (mitología)|titanes]] planean su escape desde el [[Tártaro (mitología)|Tártaro]].
