La tradición dice que fue fundada por Juán Huarín (de donde le vendría su nombre) y María Jiray. La fundación [[España|española]] correspondió al [[Virrey Toledo]] en [[1572]], bajo el nombre de Santo Domingo de Huari. Su creación como Distrito se llevó a cabo durante la Independencia del Perú.en el antigo mapa sobre Espana,hay el nombre huari,como se sabe cuando espana fue conquistada por los Arabes de 711 a 1492 d.J , muchos de los pueblos Espanoles fueron dados de nombres Arabes como "Gerez, Jaen,cordova,cadiz,andalucia, etc,y cuando america fue descubierto por Cristobal Colon en 1492,los Espanoles imvaden el peru y el resto de America apartir de 1500 d.J, permanecen 300 anos, luego de la supuesta independencia ,pasa el poder a sus desendientes los "criollos",que gobiernan el peru desde hace 200 anos y son estos los "criollos" que han continuado cambiado el nombre de los pueblos Indigenas quechuas en "Arabo Espanoles",como en este caso huari,Lima,Trujillo,etc.
