Por la [[Selección de fútbol de Argentina|Selección]] jugó los [[Campeonato Mundial de Fútbol|Mundiales]] de [[Copa Mundial de Fútbol de 1998|1998]] y [[Copa Mundial de Fútbol de 2002|2002]]. En éste último fue duramente criticado por la afición albiceleste,luegotras sesu confirmariapobre quedesempeño elen volantela creativo argentino habia aceptado dinero por parte dederrota contra [[Selección de fútbol de Inglaterra|Inglaterra]] para bajar su rendimiento. Argentina perdio por 1-0. Luego de ese partido, [[Marcelo Bielsa]], director técncio de la selección en ese entonces, decide excluirlo de los titulares para el último partido contra [[Selección de fútbol de Suecia|Suecia]], aunque acabaría ingresando en el complemento. El partido terminaría con un empate y,de esta manera, Argentina se despedía en primera ronda, obteniendo así el peor resultado en la historia de los mundiales.Ocho años más tarde, y a pocos días de comenzar el mundial de Sudáfrica 2010, Verón afirma que ha recuperado un respeto perdido<ref>{{cita web | url = http://www.derf.com.ar/despachos.asp?cod_des=341857&ID_Seccion=31&fecemi=%2026/05/2010 | título = Verón: "Siento que recuperé un respeto" | editor = Agencia Federal de Noticias de Argentina}}</ref>.
El [[27 de febrero]] de 2007, el seleccionador [[Alfio Basile]] lo convoca para entrenar con la selección Argentina en el predio de [[Ezeiza]], tras una ausencia de más de tres años.
