El tiempo de incubación de la bacteria en el ser humano, es decir desde que entra al organismo hasta que se manifiesta puede ser de 20002 a 4 semanas. En esta primera fase la enfermedad se muestra con síntomas similares a los del [[resfriado común]], una presentación clínica que es muy similar al [[dengue]], [[fiebre amarilla]], [[malaria]], [[influenza]] y muchas otras enfermedades tropicales, caracterizada por [[fiebre]], [[cefalea|dolor de cabeza]] y [[mialgia|dolor muscular]], haciendo que ese período inicial sea difícil de diagnosticar y orientar un tratamiento oportuno.<ref>GONGORA, Agustín; PARRA, Jorge; APONTE, Luz and GOMEZ, Luz. [http://www.scielosp.org/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0124-00642008000200007&lng=en&nrm=iso Seroprevalencia de Leptospira spp . en Grupos de Población de Villavicencio, Colombia] (en español). Rev. salud pública [online]. 2008, vol.10, n.2 [cited 2009-10-22], pp. 269-278. ISSN 0124-0064. doi: 10.1590/S0124-00642008000200007.</ref>
Luego de esta fase y de un periodo sin molestias, puede seguir una fase de mayor gravedad de la enfermedad, dependiendo del grupo serológico bacteriano, presentándose otros síntomas como:
