Diferencia entre revisiones de «Ácido ribonucleico»
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* '''[[ARN de interferencia]]'''. Los ARN interferentes (ARNi o iRNA) son moléculas de ARN que suprimen la expresión de genes específicos mediante mecanismos conocidos globalmente como [[ribointerferencia]] o interferencia por ARN. Los ARN interferentes son moléculas pequeñas (de 20 a 25 nucléotidos) que se generan por fragmentación de precursores más largos. Se pueden clasificar en tres grandes grupos:<ref>Grosshans, H. & Filipowicz, W. 2008. Molecular biology: the expanding world of small RNAs. ''Nature'', 451(7177):414-6 [http://www.nature.com/doifinder/10.1038/451414a]</ref>
** [[Micro ARN]]. Los micro ARN (miARN o RNAmi) son cadenas cortas de 21 ó 22 nucleótidos hallados en células eucariotas que se generan a partir de precursores específicos codificados en el [[genoma]]. Al transcribirse, se pliegan en horquillas intramoleculares y luego se unen a enzimas
** [[siRNA|ARN interferente pequeño]]. Los ARN interferentes pequeño (ARNip o [[siARN]]), formados por 20-25 nucleótidos, se producen con frecuencia por rotura de ARN [[virus|virales]], pero pueden ser también de origen endógeno.<ref>{{cita publicación | autor=Vázquez, F., Vaucheret, H., Rajagopalan, R., Lepers, C., Gasciolli, V., Mallory, A.C., Hilbert, J., Bartel, D.P. & Crété, P.| título=Endogenous ''trans''-acting siRNAs regulate the accumulation of ''Arabidopsis'' mRNAs | publicación=Molecular Cell| año=2004| volumen=16| número=1| páginas= 69–79| doi=10.1016/j.molcel.2004.09.028 | pmid = 15469823}}</ref><ref>{{cita publicación |autor=Watanabe, T., Totoki, Y., Toyoda, A., ''et al'' |título=Endogenous siRNAs from naturally formed dsRNAs regulate transcripts in mouse oocytes |publicación=Nature |volumen=453 |número=7194 |páginas=539–43 |año=2008 |mes=May |pmid=18404146 |doi=10.1038/nature06908}}</ref> Tras la transcripción se ensambla en un complejo proteico denominado RISC (''RNA-induced silencing complex'') que identifica el ARNm complementario que es cortado en dos mitades que son degradadas por la maquinaria celular, bloquean así la expresión del gen.<ref>{{cita publicación |autor=Sontheimer, E.J., Carthew, R.W. |título=Silence from within: endogenous siRNAs and miRNAs |publicación=Cell |volumen=122 |número=1 |páginas=9–12 |año=2005 |mes=July |pmid=16009127 |doi=10.1016/j.cell.2005.06.030}}</ref><ref>{{cita publicación | autor=Doran, G.| título=RNAi – Is one suffix sufficient? | publicación=Journal of RNAi and Gene Silencing | año=2007| volumen=3| número=1| páginas=217–19 | url=http://libpubmedia.co.uk/RNAiJ-Issues/Issue-5/Doran.htm}}</ref><ref>{{cita publicación |autor=Pushparaj, P.N., Aarthi, J.J., Kumar, S.D., Manikandan, J. |título=RNAi and RNAa - The Yin and Yang of RNAome |publicación=Bioinformation |volumen=2 |número=6 |páginas=235–7 |año=2008 |pmid=18317570 |pmc=2258431}}</ref>
** [[ARN asociados a Piwi]].<ref name="Hartig2007">{{cita publicación | autor = Hartig, J.V., Tomari, Y., Förstemann, K. | título = piRNAs--the ancient hunters of genome invaders.| año = 2007 | publicación = Genes Dev. | volumen = 21 | número = 14 | id = 1707-13 }} [http://genesdev.cshlp.org/cgi/content/full/21/14/1707]</ref> Los ARN asociados a Piwi son cadenas de 29-30 nucleótidos, propias de [[animales]]; se generan a partir de precursores largos monocatenarios, en un proceso que es independiente de [[Drosha]] y [[Dicer]]. Estos ARN pequeños se asocian con una subfamilia de las proteínas "Argonauta" denominada proteínas [[Piwi]]. Son activos las células de la [[línea germinal]]; se cree que son un sistema defensivo contra los [[transposones]] y que juegan algún papel en la [[gametogénesis]].<ref name=fruitfly_piRNA>{{cita publicación | autor=Horwich, M.D., Li, C., Matranga, C., Vagin, V., Farley, G., Wang, P, & Zamore, P.D.| título=The ''Drosophila'' RNA methyltransferase, DmHen1, modifies germline piRNAs and single-stranded siRNAs in RISC| publicación=Current Biology| año=2007| volumen=17| páginas=1265–72| doi=10.1016/j.cub.2007.06.030 | pmid = 17604629}}</ref><ref>{{cita publicación | autor=Girard, A., Sachidanandam, R., Hannon, G.J. & Carmell, M.A.| título=A germline-specific class of small RNAs binds mammalian Piwi proteins| publicación=Nature| año=2006| volumen=442| páginas=199–202| doi=10.1038/nature04917 | pmid = 16751776}}</ref>
* '''[[Antisentido|ARN antisentido]]'''. Un ARN antisentido es la hebra complementaria (no codificadora) de un hebra ARNm (codificadora). La mayoría inhiben genes, pero unos pocos activan la transcripción.<ref>{{cita publicación | autor=Wagner, E.G., Altuvia, S., Romby, P.| título=Antisense RNAs in bacteria and their genetic elements| publicación=Adv Genet.| año=2002| volumen=46| páginas=361–98| pmid=11931231| doi=10.1016/S0065-2660(02)46013-0}}</ref> El ARN antisentido se aparea con su ARNm complementario formando una molécula de doble hebra que no puede traducirse y es degradada enzimáticamente.<ref>{{cite book | author=Gilbert, S.F. |title=Developmental Biology | edition=7th |publisher=Sinauer | isbn=0878932585 | pages=101–3 | year=2003 | oclc=154656422 154663147 174530692 177000492 177316159 51544170 54743254 59197768 61404850 66754122}}</ref> La introducción de un [[transgen]] codificante para un ARNm antisentido es una técnica usada para bloquear la expresión de un gen de
* '''[[ARN largo no codificante]]'''. Muchos ARN largos no codificantes (ARNnc largo o long ncARN) regulan la expresión génica en eucariotas;<ref>{{cita publicación |autor=Amaral, P.P., Mattick, J.S. |título=Noncoding RNA in development |publicación=Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society |volumen= 19|número= |páginas= 454|año=2008 |mes=October |pmid=18839252 |doi=10.1007/s00335-008-9136-7 |url=}}</ref> uno de ellos es el [[Xist]] que recubre uno de los dos [[cromosoma X|cromosomas X]] en las hembras de los [[mamífero]]s inactivándolo ([[corpúsculo de Barr]]).<ref>{{cita publicación | autor=Heard, E., Mongelard, F., Arnaud, D., Chureau, C., Vourc'h, C. & Avner, P.| título=Human ''XIST'' yeast artificial chromosome transgenes show partial X inactivation center function in mouse embryonic stem cells | publicación=Proc. Natl. Acad. Sci. USA| año=1999| volumen=96| número=12| páginas=6841–46| pmid=10359800 | doi = 10.1073/pnas.96.12.6841}}</ref>
* '''[[Riboswitch]]'''. Un riboswitch es una parte del ARNm (ácido ribonucleico mensajero) al cual pueden unirse pequeñas moléculas que afectan la actividad del gen.<ref name="pmid15919195 ">{{cita publicación | autor = Tucker, B.J., Breaker, R.R. | título = Riboswitches as versatile gene control elements | publicación = Curr Opin Struct Biol | volumen = 15| número = 3 | páginas = 342–8 | año = 2005 | pmid = 15919195| doi = 10.1016/j.sbi.2005.05.003 }}</ref><ref name="pmid14698618">{{cita publicación | autor = Vitreschak, A.G., Rodionov, D.A., Mironov, A.A. & Gelfand, M.S. | título = Riboswitches: the oldest mechanism for the regulation of gene expression? | publicación = Trends Genet | volumen = 20 | número = 1 | páginas = 44–50 | año = 2004 | pmid = 14698618 | doi = 10.1016/j.tig.2003.11.008 }}</ref><ref name="pmid16707260">{{cita publicación | autor = Batey, R.T. | título = Structures of regulatory elements in mRNAs | publicación = Curr Opin Struct Biol | volumen = 16 | número = 3 | páginas = 299–306 | año = 2006 | pmid = 16707260 | doi = 10.1016/j.sbi.2006.05.001}}</ref> Por tanto, un ARNm que contenga un riboswitch está directamente implicado en la regulación de su propia actividad que depende de la presencia o ausencia de la molécula señalizadora. Tales riboswitchs se hallan en la región no traducida 5' (5'-UTR), situada antes del codón de inicio (AUG), y/o en la región no traducida 3' (3'-UTR), también llamada secuancia de arrastre,<ref name=dev /> situada entre el codón de terminación (UAG, UAA o UGA) y la cola poli A.<ref name="pmid16707260" />
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