Direccionalidad
En biología molecular y bioquímica, la direccionalidad se refiere a la orientación química de punta a punta de un solo filamento o hebra de ácido nucleico. La convención química de nombrar los átomos de carbono en la pentosa de los nucleótidos numéricamente le confiere los nombres de extremo 5' y extremo 3' (generalmente pronunciados "extremo cinco prima" y "extremo tres prima", respectivamente). La posición relativa de estructuras a lo largo de un filamento de ácido nucleico, incluidos los centros de unión de genes y varias proteínas, usualmente se denominan: upstream (literalmente, contra corriente o río arriba, es decir, "hacia 5'") si es hacia el extremo 5', o downstream (literalmente, río abajo, es decir, "hacia 3'").
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f2/Nukleotid_num.svg/220px-Nukleotid_num.svg.png)
La importancia de usar esta convención de nombres reside en el hecho de que los ácidos nucleicos sólo pueden sintetizar in vivo en una dirección 5' a 3'; porque la polimerasa usada para ensamblar nuevos filamentos debe unir un nuevo nucleótido al grupo 3'-hidroxilo (-OH) a través de un enlace fosfodiéster. Por convención, las secuencias de filamentos simples de ADN o ARN se escriben en dirección 5' a 3'.[cita requerida]
Extremo 5'
editarEl extremo 5'- (pronunciado "cinco prima") designa el extremo de una hebra de ADN o ARN que coincide con el grupo fosfato del quinto carbono de la respectiva ribosa o desoxirribosa terminal. Un grupo fosfato unido al extremo 5' permite la ligación de dos nucleótidos; por ejemplo, el enlazado covalente del grupo 5'-fosfato al 3'-hidroxilo de otro nucleótido, para formar un enlace fosfodiéster. La remoción del 5'-fosfato previene la ligación. Para prevenir ligados indeseados de ácidos nucleóticos (por ejemplo la autoligación de un vector plásmido en clonado de ADN), los biólogos moleculares comúnmente remueven el 5'-fosfato con una fosfatasa.
Extremo 3'
editarEste extremo de una hebra de ADN o ARN coincide con el grupo hidroxilo del tercer carbono de la respectiva ribosa o desoxirribosa terminal.
Referencias
editar- Lodish; et al. (2004). Molecular Cell Biology (5th edición). Nueva York: W.H. Freeman and Company. ISBN 0716743663.
Enlaces externos
editar- Glosario de biología molecular (en inglés).