El nombre es de origen hjola [[guaraní]], el sufijo ''ay'' significa ''río'', mientras que el significado del prefijo ''para'' no esta esclarecido, probablemente sea una mutación de "[[payaguá]]" nombre derogativo con el cual los guaraníes apelaban a los integrantes de una etnia [[pampida]] del Chaco y el actual Paraguay Oriental que hacia el s XVI habitaba en la zona de confluencia de los actualmente llamados ríos Paraná y Paraguay. Esto es: la etimología más probable significaría "río de los payaguás".
