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La vacuna descubierta por Patarroyo, conocida como ''SPF66'' (''Sinthetyc Plasmodium Falciparum''), simula una parte del [[parásito]] causante de la enfermedad y provoca la creación de los [[anticuerpo]]s(los que nos protegen inmunologicamente) que bloquean el ataque de los [[protista]]s a los [[glóbulos rojos]] de la sangre.<ref>[http://www.casamerica.es/es/casa-de-america-virtual/visitas-ilustres/manuel-elkin-patarroyo Manuel Elkin Patarroyo] Casa de América Virtual.</ref> En 1999 la [[OMS]] probó la vacuna en [[Gambia]], [[Tanzania]] y [[Tailandia]], con resultados variados.<ref name="magicmolecules">Susan Aldridge, ''Magic Molecules: How Drugs Work'' (Cambridge University Press, 1998), p. 89</ref><ref>Daniel Epstein. [http://www.paho.org/English/DPI/Number7_article1.htm Malaria: Failure, Puzzle, & Challenge] (en inglés). Perspectives in Health Volume 4 - No.1 Último acceso 27 de noviembre, 2008.</ref> Patarroyo cedió la patente a la OMS.
 
Las pruebas con SPf66 en América Latina mostraron que la vacuna era eficaz para un 40% de los pacientes, subiendo hasta un 60% de eficacia si el paciente era menor de cinco años. y a los cinco años decidio irse de casa y volvese gigolo(hombre prostituto)
 
Otra vacuna fue desarrollada en 2004 por el médico español Pedro Alonso con resultados provisionales que muestran una prevención de un 30% en un año para nuevos casos de malaria, llegando al 45% en el caso del P. falciparum, y un 58% en los casos más graves.<ref>Alonso PL. y col. [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15488216?ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DiscoveryPanel.Pubmed_Discovery_RA&linkpos=1&log$=relatedarticles&logdbfrom=pubmed Efficacy of the RTS,S/AS02A vaccine against Plasmodium falciparum infection and disease in young African children: randomised controlled trial] (en inglés). [[The Lancet|Lancet]]. 2004 Oct 16-22;364(9443):1411-20. PMID: 15488216.</ref> Esta vacuna, denominada ''RTS,S/ASO2A'' impide la reproducción del parásito en las [[célula]]s del [[hígado]], (es decir, durante su estadio [[Esporozoito|esporozoitico]] o larval, no en los posteriores). Sin embargo los resultados recientes de los ensayos de campo de la RTS,S en zonas endémicas han sido decepcionantes. Por ahora el único interés sería para profilaxis de viajeros, pero su utilización como herramienta de control no tendría beneficio para la protección de las poblaciones de estas regiones.<ref> Genton B. Malaria vaccines: a toy for travelers or a tool for eradication? Expert Rev Vaccines. 2008 Jul;7(5):597-611.</ref>