La fecha oficial de la fundación del muncipio data de [[1840]] y se cree que su fundador fue el gobernador de [[Petén]] Juan Antonio Ruiz y Bustamante.
En el año [[1848]] Santa Ana, comienza siendo una estancia ganadera de estado, fundada por Santiago Artigas, en el “Rincón del Mandisoví”, por mandato del por entonces Gobernador de la Provincia de Entre Ríos, Don Justo José de Urquiza.
Mas tarde, las tierras se vendieron a particulares, llegando a manos de Don Cupertino Otaño, quien las fracciona diseñando el casco urbano, de 55 manzanas atravesadas en su corazón por las vías del ferrocarril General Urquiza.
El pueblo llevó el nombre de “Pueblo Otaño”, en 1901 se bendice y entroniza a su patrona Santa Ana, tomando así el nombre definitivo el poblado.