Mientras se hallaba meditando en la Zona Negativa, Mar-Vell se vio transportado al año [[2007]] al tocar una grieta espacio-temporal. Apareció en [[Isla Fantasía]] (la penitenciaría para superhéroes y supervillanos de la Zona Negativa), donde se encontró con [[el Vigía]], [[Reed Richards]] y [[Tony Stark]], que le explicaron que su viaje en el tiempo era resultado de sus experimentos para abrir un portal a la Zona Negativa, y le pidieron que fuera el alcaide de la prisión durante [[Civil War]], viéndose obligado a participar en la última batalla, apoyando al bando Pro-Registro.
La siguiente saga marveliana, Secret Invasion, nos adentra en un mundo donde algunos grandes heroes están siendo sustituidos por skrulls prácticamente indetectables para el mundo entero. De tal forma q durante el desarrollo de la saga, se muesta el verdadero origén de este Capitán Marvel. Siendo manipulado el Skrull que debía suplantar al fallecido Márvel, el proceso falla y este queda totalmente convencido de que es el auténtico Capitán Márvel, llegado al punto de q Stark no confía en su autenticidad manda a buscar sus resto a la luna de jupiter donde descansaba, comprobando q ciertamente era un impostor. Al descubrir él su origen tras un encuentro con otros Skrulls, decide tomar partida por los humanos como hubiera hecho el auntentico Márvel,durante el combate Noh-Varr, el guerrero Kree, evade a una nave de combate Skrull, que se estrella en la superficie terrestre. Al investigar descubre a Marvel, cuyo último aliento sirve para inspirar al joven renegado que asuma la responsabilidad de ser el protector del mundo ante la invasión. Marvel muere, dejando al descubierto su verdadera naturaleza Skrull.
