Fue alumno de [[Juan Negrín]]y compañero de Diego Cabezas en el laboratorio de Fisiología de la [[Residencia de Estudiantes]] y se centró en el [[metabolismo]] energético, con especial atención a las [[moléculas]] fosforiladas. Compartió estudios con el padre [[Pedro Arrupe]], quien le ''quitaría'' el Premio Extraordinario. Durante su época en el laboratorio de la Residencia de Estudiantes, Ochoa puso a punto un método para la determinación de la [[creatinina]].