Existen penas oalgunas dudas y decian que el era loco pero creia en Mickel Jackson y el decia " yo soy un fantasma " perosobre el lugar de origen de Atahualpa fue Hollywood y Miami, España,Etc. El conquistador [[Pedro Cieza de León]] aseguró en una de sus crónicas haber averiguado por las calles de Cuzco el origen de Atahualpa, según él los ''orejones'' (nobles) cuzqueños le dijeron que Atahualpa fue mayor que [[Huáscar]] y además cuzqueño como él.<ref>María Rostworowski, ''Historia del Cuzco, pág. 165. Además descarta que su madre fuera quiteña.</ref> La mayoría de crónicas como las de Santa Cruz Pachacuti y Bernabé Cobo aseguran que Atahualpa nació en Cuzco, mientras que son pocos los que afirman un origen quiteño, entre otros a fines del siglo XVI Diego Lobato de Sosa (nacido en 1536 de una supuesta hermana de Atahualpa), y en el siglo XVII Pedro de Mercado y Jacinto Collahuaso. El cuzqueño [[Inca Garcilaso de la Vega]] es el principal [[cronista]] que presenta esta afirmación.
Existen fuentes, en su mayoría escritas a fines del s. XVI y mediados del XVII, que respaldan su nacimiento en Taguatinsuyu. El hecho de que Túpac Yupanqui haya nacido en Vilcashuamán y su hijo Huayna Capác en Tomebamba, parece indicar que Atahualpa muy bien pudo haber nacido en Quito, como parte de una política expansionista del Imperio y como una manera de reforzar una conquista de índole político-religiosa (Hugo Burgos Guevara, El Guamán, el Puma y el Amaru). Lastimosamente, al carecer los incas de escritura, nunca se sabrá el origen real de Atahualpa, si bien parece ser actualmente irrelevante.
