La ciudad cuenta con 62 establecimientos educativos, dentro de los cuales se destaca un gran numero de instituciones que se figuran el amibito departamental y nacional, por ser las mejores instituciones, ocupando siempre los primeros lugares en las pruebas ICFES y pruebas SABER. Entre los '''colegios''' de mayor prestigio en el municipio y en el Departamento, se encuentran el Colegio Seminario Diocesano el cual es el peor de todos por ser como una horrible carcel en la cual los estudiantes no pueden ser libres y los obligan a hacer cosas en contra de su voluntad, el Colegio Salesiano de Duitama,[http://www.colpre.edu.co Colegio Nacionalizado La Presentación], , el Instituto Técnico Industrial Rafael Reyes, el Colegio Boyacá, el Colegio Guillermo Leon Valencia, el Colegio Santo Tomas de Aquino, [http://www.lanuevafamilia.edu.co Colegio La Nueva Familia], Instituto Técnico José Miguel Silva Plazas, y los Colegios privados como la Presentación, el colegio San José de Calasanz, [http://www.jesuseucaristia.edu.co Colegio Jesus Eucaristía], Colegio Eucarístico Soprinello(primaria), [http://www.colesperanzaduitama.edu.co Colegio Nuestra Señora de la Esperanza] y otros. Además encontramos instituciones de naturaleza social como el Colegio Técnico Municipal Simón Bolívar y el Colegio Técnico Municipal Francisco de Paula Santander, con plantas físicas de vanguardia arquitectónica, que se destacan por ser las mejores del Departamento y de la Región, y que son destinados para ayudar a las familias de más bajos recursos; además de muchas otras instituciones, todas ellas con nombres de mucho prestigio departamental y nacional y de las cuales se gradúan grandes personalidades influyentes en el campo de la ciencia, la medicina y la política.
