En [[mayo de 2008]], accedió al cargo de entrenador del [[Racing Club de Lens|RC Lens]], el equipo de su corazón.<ref>{{cita web|url=http://www.lemonde.fr/sport/article/2008/05/28/wallemme-remplace-papin-a-lens_1050781_3242.html|título=Wallemme remplace Papin à Lens|obra=[[Le Monde]]|fecha=28 de mayo de 2008|idioma=francés}}</ref> Logró ganar la [[Ligue 2]] y por lo tanto ascendió a la máxima categoría,<ref>{{cita web|url=http://www.lemonde.fr/sport/article/2009/05/16/le-rc-lens-retrouve-la-ligue-1-et-veut-y-rester_1194176_3242.html|título=Le RC Lens retrouve la Ligue 1 et veut y rester|autor=[[Reuters]]|obra=[[Le Monde]]|fecha=16 de mayo de 2009|idioma=francés}}</ref> obteniendo la permanencia en la [[Ligue 1 2009/-10|temporada siguiente]]. Sin embargo, los malos resultados en la [[Ligue 1 2010/-11]] provocaron su destitución en [[enero de 2011]].<ref>{{cita web|url=http://www.liberation.fr/sports/2011/01/03/en-bref_704416|título=En bref|obra=[[Libération (periódico)|Libération]]|fecha=3 de enero de 2011|idioma=francés}}</ref>
;Selección del Congo y AJ Auxerre
En [[agosto de 2011]], fue nombrado el máximo responsable de la [[Selección de fútbol del Congo|selección del Congo]].<ref>{{cita web|url=http://www.lequipe.fr/Football/Actualites/Wallemme-nouveau-selectionneur/224023|título=Wallemme nouveau sélectionneur|obra=[[L'Équipe]]|fecha=28 de agosto de 2011|idioma=francés}}</ref> Al año siguiente, sin dejar de ser el seleccionador del {{sel|Congo}}, se incorporó al [[Association de la Jeunesse Auxerroise|AJ Auxerre]] para la recta final de la [[Ligue 1 2011/-12|temporada 2011-12]].<ref>{{cita web|url=http://sport24.lefigaro.fr/football/ligue-1/Homes-Clubs/auxerre/actualites/wallemme-au-chevet-de-l-aja-542645|título=Wallemme au chevet de l’AJA|autor=Egly, Florian|obra=[[Le Figaro]]|fecha=18 de marzo de 2012|idioma=francés}}</ref> No pudo evitar el descenso del equipo francés a la [[Ligue 2]], pero renuevarenovó con la entidad para el curso siguiente. En [[octubre de 2012]], dimitedimitió como seleccionador del {{sel|Congo}} para concentrarse en su trabajo en el [[Association de la Jeunesse Auxerroise|Auxerre]],<ref>{{cita web|url=http://www.lequipe.fr/Football/Actualites/Wallemme-va-demissionner/321855|título=Wallemme va démissionner|autor=A.Bi.|obra=[[L'Équipe]]|fecha=24 de octubre de 2012|idioma=francés}}</ref> pero poco después también dejó el banquillo del conjunto borgoñón de común acuerdo con el club a raíz de los malos resultados.<ref>{{cita web|url=http://www.lequipe.fr/Football/Actualites/Wallemme-quitte-le-club/331108|título=Wallemme démis de ses fonctions|obra=[[L'Équipe]]|fecha=3 de diciembre de 2012|idioma=francés}}</ref>
;Segunda etapa en Bélgica
Volvió a la [[Liga belga de fútbol|Liga belga]] de la mano del [[White Star Bruxelles]] en [[2013]],<ref>{{cita web|url=http://www.lavoixdunord.fr/sports/jean-guy-wallemme-rebondit-en-devenant-entraineur-des-ia182b205n1339721|título=Jean-Guy Wallemme rebondit en devenant entraîneur des White Stars de Bruxelles|obra=La Voix du Nord|fecha=18 de junio de 2013|idioma=francés}}</ref> pero esfue destituido antes de comenzar la temporada debido a un enfrentamiento con los dirigentes del club.<ref>{{cita web|url=http://www.lavoixdunord.fr/sports/football-jean-guy-wallemme-et-bruxelles-c-est-deja-fini-ia0b0n1446699|título=Football : Jean-Guy Wallemme et Bruxelles, c’est déjà fini|obra=La Voix du Nord|fecha=30 de julio de 2013|idioma=francés}}</ref> En [[enero de 2014]] esfue nombrado técnico del RWDM Brussels FC, al que entrenaentrenó hasta el término de la temporada.
;Etapa en Argelia
En [[julio de 2014]], firmó con el [[USM Bel-Abbès]] de [[Argelia]];<ref>{{cita web|url=http://www.lequipe.fr/Football/Actualites/Wallemme-en-algerie/483429|título=Wallemme en Algérie|autor=A.Bi.|obra=[[L'Équipe]]|fecha=18 de julio de 2014|idioma=francés}}</ref> pero en el mercado de invierno, decidedecidió fichar por el [[JS Kabylie]].<ref>{{cita web|url=http://www.lequipe.fr/Football/Actualites/Wallemme-maintenu/536020|título=Wallemme maintenu|obra=[[L'Équipe]]|fecha=13 de febrero de 2015|idioma=francés}}</ref> En [[junio de 2015]], se incorporaincorporó al [[ASO Chlef]],<ref>{{cita web|url=http://www.lequipe.fr/Football/Actualites/Un-nouveau-club-algerien-de-d2-pour-jean-guy-wallemme/568455|título=Un nouveau club algérien de D2 pour Jean-Guy Wallemme|obra=[[L'Équipe]]|fecha=22 de mayo de 2015|idioma=francés}}</ref> del cual se desvinculadesvinculó a los 8 meses por insuficiencia de resultados.<ref>{{cita web|url=http://www.lequipe.fr/Football/Actualites/Jean-guy-wallemme-quitte-l-aso-chlef/630833|título=Jean-Guy Wallemme quitte l'ASO Chlef|obra=[[L'Équipe]]|fecha=2 de febrero de 2016|idioma=francés}}</ref>
