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Nacido en la localidad [[provincia de La Coruña|coruñesa]] de [[Laxe (La Coruña)|Laxe]], tras el fallecimiento de su padre, en 1914, se hizo cargo de su educación su abuelo, Isidro Pondal Abente (hermano del poeta [[Eduardo Pondal]]), influyendo en su temprana vocación por la química. Estudió el Bachillerato en [[Santiago de Compostela]] y la carrera de Ciencias Químicas en la [[Universidad de Madrid]], obteniendo la licenciatura en [[1922]]. En [[1923]] obtuvo una plaza de profesor auxiliar de [[Química Inorgánica]] y [[Química analítica|Analítica]] en la Facultad de Ciencias de la [[Universidad de Santiago de Compostela]]. Entretanto, aparecieron sus primeros trabajos sobre geoquímica, publicados en la revista del Seminario de Estudios Gallegos, nacido recientemente y del que era miembro desde 1924.
 
En 1930 se le concede una pensión de [[Junta para Ampliación de Estudios e Investigaciones Científicas | JAE]] para estudiar Geoquímica en [[Zúrich]]<ref>{{cita publicación |título=Real orden concediendo a D. Isidro Parga Pondal, Auxiliar de la Facultad de Ciencias de la Universidad de Santiago, una pensión de un año para estudiar en Alemania y Suiza Geoquímica. |publicación=Gaceta de Madrid |número=114 |páginas=492-493 |ubicación=Madrid |url=http://boe.es/datos/pdfs/BOE//1930/114/A00492-00493.pdf |fecha=24 de abril de 1930 |ref=BOE-A-1930-4719 |fechaacceso=12 de octubre de 2017}}</ref>, volviendo en [[1933]] a Santiago. Con la creación del Laboratorio de [[Geoquímica]] de la Universidad de Santiago, comenzó sus investigaciones sobre geología de Galicia y formó a los primeros geoquímicos españoles. En [[1934]] terminó su tesis doctoral obteniendo la calificación de sobresaliente ''cum laude'' en la Universidad de Madrid.
 
fue en esta época cuando se convirtió en uno de los profesores investigadores más importantes de la Universidad de Santiago de Compostela, llegando a impartir cuatro asignaturas diferentes. Cambió la relación entre alumnos y profesores, compartiendo conjuntamente el tiempo de ocio y la investigación, incorporando a la mujer en los equipos de investigación y poniendo en contacto a las aulas compostelanas con la comunidad científica internacional.
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