Cuando en el episodio "The Last Man", el [[John Sheppard|Coronel Sheppard]] viaja a [[Atlantis (ciudad)|Atlantis]], 48000 años al futuro, se encuentra con un holograma dejado por [[Rodney McKay|McKay]], el cual le explica que meses después de que desapareciera, el [[IOA]] le entrego a la [[Samantha Carter|Coronel Carter]] la nueva nave Fénix, para apoyar a la [[Expedición Atlantis]]. Si bien la nave recién había salido de la línea de ensamblaje, la mitad de sus sistemas [[Asgard (Stargate)|Asgard]] aún no estaban terminados y la otra mitad no funcionaban , los miembros de la expedición se las arreglaron para tenerla lista para el combate en un mes.
Una vez estuvo operacionaloperativa, la nave fue usada en ataques relámpagos contra las [[Naves Colmena Wraith|Naves Colmena]] de Michael. Esta estrategia funciono y se logro infligir un daño considerable a su Flota durante un tiempo. Sin embargo, Michael infiltro falsa información para llevar al crucero a una trampa. La nave fue emboscada por 3 [[Naves Colmena Wraith|Naves Colmena]], las cuales dañaron seriamente al Fénix impidiéndole escapar al hiperespacio. Cuando el hiperpropulsor comenzó a sobrecargarse, la [[Samantha Carter|Coronel Carter]] decidió transportar a toda la tripulación a la superficie del planeta, mientras ella puso al Fénix en rumbo de colisión contra una de las [[Naves Colmena Wraith|Naves Colmena]]. La explosión resultante destruyo a las dos restantes.
Debido a que todo esto ocurre en la línea de tiemponarración alterna, se desconoce si la nave aparece en lael "líneatiempo temporalreal real"de lo narrado, pero se puede deducir que la nave estaba bajo construcción cuando [[John Sheppard|Sheppard]] viajó al futuro, así que es posible que si aparezca luego en la serie.
