Un '''marcador genético''' o '''marcador molecular''' es un segmento defragmento [[ADN]] con una ubicación física identificable ([[locus]]) en un [[cromosoma]] y cuya [[herencia genética]] se puede rastrear. Un marcador puede ser un [[gen]], o puede ser alguna sección del ADN sin función conocida. Dado que los segmentos del ADN que se encuentran contiguos en un [[cromosoma]] tienden a heredarse juntos, los marcadores se utilizan a menudo como formas indirectas de rastrear el patrón hereditario de un gen que todavía no ha sido identificado, pero cuya ubicación aproximada se conoce. Los marcadores se usan para el [[mapeo genético]] como el primer paso para encontrar la posición e identidad de un gen.
Son ampliamente utilizados en [[genética]] humana, vegetal, animal y microbiana. Permiten evidenciar variaciones ([[Polimorfismo genético|polimorfismos]]) en la secuencia del ADN entre dos individuos, modifiquen éstas o no su fenotipo. Funcionan como señaladores de diferentes regiones del [[genoma]].
