En [[1444]] fue ocupado por las religiosas clarisas[[Clarisas]] por expreso deseo de la reina María, esposa de [[Alfonso el Magnánimo]], que quería disponer de un lugar de retiro junto a la ciudad, y a tal efecto lo colmó de donaciones y privilegios. La reina, que vivía con sus damas en el vecino Palacio del Real, tenía estancias propias en el monasterio, donde también está su sepulcro. También está enterrada allí la infanta [[María de Aragón]], hija de [[Fernando el Católico]]. Su biblioteca consta de medio centenar de pergaminos, documentos y libros de gran valor, por ejemplo, el manuscrito autógrafo de la ''Vita Christi'' de Sor [[Isabel de Villena]], principal abadesa del cenobio y una de las primeras ediciones de esa obra. También hay varios manuscritos de [[Jaume Roig]], autor del ''L'Espill'', quien fue médico de las monjas y uno de los que aportaron dinero para las construcción del monumento, así como diversos [[cancionero]]s del siglo XV. También hay una primera edición de la ''Historia del convento de la Trinidad'' de [[Agustí Sales]], la bula del papa [[León X]] y, entre otros, el ''Libro de la casa de la Reina'', especie de inventario de las grandes familias de la Valencia del siglo XV y las limosnas que aportaron para construir el monasterio.
El claustro y el refectorio son de estilo gótico y la iglesia de decoración barroca. Hay inscripciones en las claves de la bóveda del refectorio y un arco gótico de doble vuelta que gira sobre sí mismo. El "compás" o segundo claustro es una plaza porticada desde la que se accede a la iglesia. La fachada del templo es un magnífico ejemplo del [[gótico flamígero]] y su decoración recuerda a la [[Lonja]] y hay una réplica de un magnífico rosetón de cerámica renacentista. También hay diversas pinturas barrocas y numerosas reliquias, entre ellas un fragmento de la cruz de Cristo o ''lignum crucis'' y una espina de su corona.
